Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 MCM10YIL150C 1716 nt1.77□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 MYO4YAL029C 4416 nt1.77□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 CFT1YDR301W 4074 nt1.76□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 RLM1YPL089C 2031 nt1.76□□□□□ -2.13 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.76□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.76□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 ZIP1YDR285W 2628 nt1.75□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 ZIP2YGL249W 2115 nt1.75□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 RAD34YDR314C 2079 nt1.75□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 RPS25BYLR333C 327 nt1.75□□□□□ -2.13 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.75□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 RTP1YMR185W 2946 nt1.74□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 APL2YKL135C 2181 nt1.74□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 MSH5YDL154W 2706 nt1.74□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 ULI1YFR026C 510 nt1.74□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 LRE1YCL051W 1752 nt1.74□□□□□ -2.13 RIP-Chip
PUF2Q12221 SAS3YBL052C 2496 nt1.74□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 NOC3YLR002C 1992 nt1.73□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 MAD1YGL086W 2250 nt1.73□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 TDA9YML081W 3756 nt1.73□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 MAK10YEL053C 2202 nt1.72□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 DCP2YNL118C 2913 nt1.72□□□□□ -2.13 RIP-Chip
PUF2Q12221 TRM3YDL112W 4311 nt1.72□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 SDH6YDR379C-A 240 nt1.72□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 COA6YMR244C-A 315 nt1.72□□□□□ -2.13 RIP-Chip
PUF2Q12221 SEC63YOR254C 1992 nt1.71□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 ANS1YHR126C 480 nt1.71□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YHR210CYHR210C 1026 nt1.71□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 COF1YLL050C 432 nt1.71□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.71□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 snR52snR52 92 nt1.71□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 PAU3YCR104W 375 nt1.7□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 RPL31AYDL075W 342 nt1.7□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.7□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YIR044CYIR044C 186 nt1.7□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.7□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 BRR2YER172C 6492 nt1.7□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 CTR9YOL145C 3234 nt1.7□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 UBR2YLR024C 5619 nt1.7□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YLR419WYLR419W 4308 nt1.7□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 IRC20YLR247C 4671 nt1.69□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YJR039WYJR039W 3366 nt1.69□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.69□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 MLH3YPL164C 2148 nt1.69□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.68□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 SEY1YOR165W 2331 nt1.68□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 IRE1YHR079C 3348 nt1.68□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 LHS1YKL073W 2646 nt1.68□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 MSH6YDR097C 3729 nt1.68□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 PIG1YLR273C 1947 nt1.68□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YNL144CYNL144C 2223 nt1.67□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 Q0143Q0143 153 nt1.67□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YGR164WYGR164W 336 nt1.67□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.67□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.67□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YOR345CYOR345C 351 nt1.67□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 HAL9YOL089C 3093 nt1.66□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 RPL33BYOR234C 324 nt1.66□□□□□ -2.14 RIP-Chip
PUF2Q12221 DGR2YKL121W 2559 nt1.66□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YLL007CYLL007C 1998 nt1.65□□□□□ -2.14
PUF2Q12221 YDL196WYDL196W 330 nt1.65□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.65□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 YOR093CYOR093C 4947 nt1.65□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 PTP2YOR208W 2253 nt1.65□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 NCA2YPR155C 1851 nt1.65□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 HMI1YOL095C 2121 nt1.64□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 PMP1YCR024C-A 123 nt1.64□□□□□ -2.15 RIP-Chip
PUF2Q12221 YEL073CYEL073C 324 nt1.64□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 IFH1YLR223C 3258 nt1.64□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 CUL3YGR003W 2235 nt1.64□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 PKH3YDR466W 2697 nt1.63□□□□□ -2.15 RIP-Chip
PUF2Q12221 SFB2YNL049C 2631 nt1.63□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 FRK1YPL141C 2598 nt1.62□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 TBS1YBR150C 3285 nt1.62□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 YDR521WYDR521W 336 nt1.62□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 AHC1YOR023C 1701 nt1.62□□□□□ -2.15 RIP-Chip
PUF2Q12221 COY1YKL179C 2040 nt1.62□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 FIG4YNL325C 2640 nt1.62□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 MON2YNL297C 4911 nt1.62□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 AIM44YPL158C 2277 nt1.61□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 PIP2YOR363C 2991 nt1.61□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 ALK1YGL021W 2283 nt1.61□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 CAT8YMR280C 4302 nt1.59□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 MYO2YOR326W 4725 nt1.59□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 VPS15YBR097W 4365 nt1.59□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.59□□□□□ -2.15
PUF2Q12221 NUP192YJL039C 5052 nt1.59□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 SLD3YGL113W 2007 nt1.58□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 YBR206WYBR206W 324 nt1.58□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 UTP21YLR409C 2820 nt1.58□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 COG4YPR105C 2586 nt1.57□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 PRP42YDR235W 1635 nt1.57□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 SLI15YBR156C 2097 nt1.56□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 PBY1YBR094W 2262 nt1.56□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 PKH2YOL100W 3246 nt1.55□□□□□ -2.16 RIP-Chip
PUF2Q12221 SNU13YEL026W 381 nt1.55□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 CDC31YOR257W 486 nt1.55□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 SAC3YDR159W 3906 nt1.55□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 NUT1YGL151W 3399 nt1.54□□□□□ -2.16
PUF2Q12221 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.54□□□□□ -2.16
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