Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.84□□□□□ -2.27
VPS68Q12016 YPR063CYPR063C 423 nt0.84□□□□□ -2.27
VPS68Q12016 PKH2YOL100W 3246 nt0.84□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 APL1YJR005W 2103 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 UTP20YBL004W 7482 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 SLD3YGL113W 2007 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 PCC1YKR095W-A 267 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YBR012CYBR012C 420 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 GEA2YEL022W 4380 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 STO1YMR125W 2586 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 RIM20YOR275C 1986 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 RAD34YDR314C 2079 nt0.82□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 MAM33YIL070C 801 nt0.82□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 RPL38YLR325C 237 nt0.82□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.82□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 NUT1YGL151W 3399 nt0.82□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 HMRA1YCR097W 381 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 RPL35AYDL191W 363 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YAR029WYAR029W 225 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YDL206WYDL206W 2289 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 MMS4YBR098W 2076 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 SMC1YFL008W 3678 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 SWI4YER111C 3282 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 NUP145YGL092W 3954 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 SET3YKR029C 2256 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 snR56snR56 88 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 GIM4YEL003W 336 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 APL3YBL037W 3078 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 CUL3YGR003W 2235 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 CDC39YCR093W 6327 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 GPG1YGL121C 381 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 HTB2YBL002W 396 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YPR197CYPR197C 564 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YDR048CYDR048C 315 nt0.78□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 PAU12YGR294W 363 nt0.78□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 YJR011CYJR011C 786 nt0.78□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 ADR1YDR216W 3972 nt0.78□□□□□ -2.28
VPS68Q12016 MSN5YDR335W 3675 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 WAR1YML076C 2835 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 PDE2YOR360C 1581 nt0.77□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YLL007CYLL007C 1998 nt0.76□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YAF9YNL107W 681 nt0.76□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 STB6YKL072W 2301 nt0.76□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YMR160WYMR160W 2451 nt0.75□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 SEC3YER008C 4011 nt0.74□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 NUP157YER105C 4176 nt0.74□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 NHP2YDL208W 471 nt0.74□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 QCR9YGR183C 201 nt0.74□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.74□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.74□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 ECM12YHR021W-A 456 nt0.74□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YIR044CYIR044C 186 nt0.74□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.74□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YCK3YER123W 1575 nt0.74□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 PTP2YOR208W 2253 nt0.73□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YDR521WYDR521W 336 nt0.73□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.73□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 CMC4YMR194C-B 222 nt0.73□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 NIP100YPL174C 2607 nt0.73□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 IFH1YLR223C 3258 nt0.73□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 YBR206WYBR206W 324 nt0.72□□□□□ -2.29
VPS68Q12016 SSS1YDR086C 243 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 TAR1YLR154W-C 375 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 YBR064WYBR064W 429 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 snR36snR36 182 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 ALY2YJL084C 3141 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 SCC2YDR180W 4482 nt0.71□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 DBP6YNR038W 1890 nt0.7□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 YDR102CYDR102C 333 nt0.7□□□□□ -2.3
VPS68Q12016 YDR344CYDR344C 444 nt0.7□□□□□ -2.3
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