Protein–RNA interactions for Protein: Q12006

PFA4, Palmitoyltransferase PFA4, yeastyeast

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4Q12006 HER1YOR227W 3741 nt1.71□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 SEY1YOR165W 2331 nt1.71□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 GCN2YDR283C 4980 nt1.7□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 PTP2YOR208W 2253 nt1.7□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.7□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 ECM12YHR021W-A 456 nt1.7□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YJL150WYJL150W 303 nt1.7□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YLR140WYLR140W 327 nt1.7□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YLL007CYLL007C 1998 nt1.69□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 RPL31AYDL075W 342 nt1.69□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.69□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 UBR2YLR024C 5619 nt1.69□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 SEC63YOR254C 1992 nt1.68□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.68□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YNL338WYNL338W 159 nt1.68□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 PRP39YML046W 1890 nt1.68□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.68□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YMR045CYMR045C 5268 nt1.68□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 ULI1YFR026C 510 nt1.67□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.67□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 MYO2YOR326W 4725 nt1.66□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 HIR3YJR140C 4947 nt1.66□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YGL217CYGL217C 342 nt1.66□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.66□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.66□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 TRS65YGR166W 1683 nt1.66□□□□□ -2.14
PFA4Q12006 YNL144CYNL144C 2223 nt1.65□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 Q0092Q0092 141 nt1.65□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 COF1YLL050C 432 nt1.65□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 TMA7YLR262C-A 195 nt1.65□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.65□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 MSH6YDR097C 3729 nt1.65□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 snR46snR46 197 nt1.64□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 CFT1YDR301W 4074 nt1.64□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 TRM3YDL112W 4311 nt1.64□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 SFB2YNL049C 2631 nt1.64□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 COA6YMR244C-A 315 nt1.63□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 PIP2YOR363C 2991 nt1.62□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 LRE1YCL051W 1752 nt1.62□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 MGA2YIR033W 3342 nt1.62□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 PAU3YCR104W 375 nt1.62□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 ATG9YDL149W 2994 nt1.62□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 PDR8YLR266C 2106 nt1.62□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 PBY1YBR094W 2262 nt1.62□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 MEC1YBR136W 7107 nt1.62□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 NCA2YPR155C 1851 nt1.62□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 SLI15YBR156C 2097 nt1.62□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 IRC20YLR247C 4671 nt1.61□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 ALK1YGL021W 2283 nt1.61□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 UTP21YLR409C 2820 nt1.61□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 MYO4YAL029C 4416 nt1.61□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 YDR521WYDR521W 336 nt1.61□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.61□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 snR52snR52 92 nt1.61□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 PKH2YOL100W 3246 nt1.61□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 COG4YPR105C 2586 nt1.6□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 RTP1YMR185W 2946 nt1.6□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 AIM44YPL158C 2277 nt1.6□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 YHR210CYHR210C 1026 nt1.6□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 SLD3YGL113W 2007 nt1.59□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 BPH1YCR032W 6504 nt1.59□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.59□□□□□ -2.15
PFA4Q12006 AHC1YOR023C 1701 nt1.59□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 YDL196WYDL196W 330 nt1.58□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 YOR093CYOR093C 4947 nt1.58□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 IFH1YLR223C 3258 nt1.58□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 LHS1YKL073W 2646 nt1.57□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 FIG4YNL325C 2640 nt1.57□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.57□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 RPL33BYOR234C 324 nt1.57□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 YOR345CYOR345C 351 nt1.57□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 YJR039WYJR039W 3366 nt1.56□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 SPO24YPR036W-A 204 nt1.56□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 YBR206WYBR206W 324 nt1.56□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 SBE22YHR103W 2559 nt1.56□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 ADR1YDR216W 3972 nt1.56□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 IRA1YBR140C 9279 nt1.55□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 NUT1YGL151W 3399 nt1.55□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 HSL1YKL101W 4557 nt1.55□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 ATP8Q0080 147 nt1.55□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 EMC5YIL027C 426 nt1.55□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 NUP192YJL039C 5052 nt1.54□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.54□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 YEL073CYEL073C 324 nt1.54□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.53□□□□□ -2.16
PFA4Q12006 HAL9YOL089C 3093 nt1.52□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 CTF4YPR135W 2784 nt1.52□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.52□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 YOR170WYOR170W 306 nt1.52□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 RAD50YNL250W 3939 nt1.51□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 DNF3YMR162C 4971 nt1.51□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 BRR2YER172C 6492 nt1.51□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 SKI3YPR189W 4299 nt1.51□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 ALY2YJL084C 3141 nt1.5□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.5□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 COY1YKL179C 2040 nt1.5□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.5□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 TBS1YBR150C 3285 nt1.49□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 CAT8YMR280C 4302 nt1.49□□□□□ -2.17
PFA4Q12006 UFD2YDL190C 2886 nt1.49□□□□□ -2.17
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