Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 SKP2YNL311C 2292 nt2.3□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 RTT107YHR154W 3213 nt2.3□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 VPS13YLL040C 9435 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 FKS3YMR306W 5358 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 PMP2YEL017C-A 132 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 YHR217CYHR217C 462 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 YBR099CYBR099C 384 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 CTR9YOL145C 3234 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 KRE33YNL132W 3171 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 RAV1YJR033C 4074 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 CHC1YGL206C 4962 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 CDC60YPL160W 3273 nt2.29□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.28□□□□□ -2.04
YAR028WP39548 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.27□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 NEW1YPL226W 3591 nt2.27□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 UBP1YDL122W 2430 nt2.27□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 RPL37BYDR500C 267 nt2.27□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.27□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 PKH2YOL100W 3246 nt2.27□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.27□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 NAB6YML117W 3405 nt2.26□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 COG4YPR105C 2586 nt2.26□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 TTI1YKL033W 3117 nt2.26□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.26□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 PDR11YIL013C 4236 nt2.26□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 SCP160YJL080C 3669 nt2.26□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.25□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.25□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.25□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.25□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.25□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.25□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 SLI15YBR156C 2097 nt2.24□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.24□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 YEF3YLR249W 3135 nt2.24□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 SSD1YDR293C 3753 nt2.24□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 PET309YLR067C 2898 nt2.24□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 PRP5YBR237W 2550 nt2.23□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 SGS1YMR190C 4344 nt2.23□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 SCD5YOR329C 2619 nt2.22□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 YNL144CYNL144C 2223 nt2.22□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 CSF1YLR087C 8877 nt2.22□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 MSB1YOR188W 3414 nt2.22□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 YOR019WYOR019W 2193 nt2.22□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.22□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 OST4YDL232W 111 nt2.22□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt2.22□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 APL1YJR005W 2103 nt2.22□□□□□ -2.05
YAR028WP39548 IRE1YHR079C 3348 nt2.21□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 snR61snR61 90 nt2.21□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 CMC4YMR194C-B 222 nt2.21□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 YNL211CYNL211C 261 nt2.21□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 DNF1YER166W 4716 nt2.21□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 YOL098CYOL098C 3114 nt2.2□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 HIR3YJR140C 4947 nt2.2□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 RTT101YJL047C 2529 nt2.2□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 UBP15YMR304W 3693 nt2.19□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 TIM9YEL020W-A 264 nt2.19□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 YLR282CYLR282C 342 nt2.19□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 YMR045CYMR045C 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 YPR097WYPR097W 3222 nt2.18□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 MDS3YGL197W 4464 nt2.18□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 TDA9YML081W 3756 nt2.18□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 IRC8YJL051W 2469 nt2.17□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 ADR1YDR216W 3972 nt2.17□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 YLL054CYLL054C 2532 nt2.17□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.17□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 FRK1YPL141C 2598 nt2.16□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 YDL206WYDL206W 2289 nt2.16□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 SBH1YER087C-B 249 nt2.16□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 MBB1YJL199C 327 nt2.16□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 BNI1YNL271C 5862 nt2.16□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 USO1YDL058W 5373 nt2.16□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 TRM3YDL112W 4311 nt2.16□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 CHS6YJL099W 2241 nt2.15□□□□□ -2.06
YAR028WP39548 YDL118WYDL118W 381 nt2.14□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.14□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 TFC3YAL001C 3483 nt2.14□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 HSL1YKL101W 4557 nt2.13□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 LHS1YKL073W 2646 nt2.13□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 POL5YEL055C 3069 nt2.13□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 YGL182CYGL182C 324 nt2.13□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.13□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 SFB2YNL049C 2631 nt2.13□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 DNA2YHR164C 4569 nt2.13□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 IST2YBR086C 2841 nt2.13□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 SOM1YEL059C-A 225 nt2.12□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 SEY1YOR165W 2331 nt2.12□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 SPO24YPR036W-A 204 nt2.11□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 TOF1YNL273W 3717 nt2.11□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 UFD2YDL190C 2886 nt2.11□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 NUT1YGL151W 3399 nt2.1□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 YJR039WYJR039W 3366 nt2.1□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 SEC16YPL085W 6588 nt2.1□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 PDR3YBL005W 2931 nt2.1□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.09□□□□□ -2.07
YAR028WP39548 GCN2YDR283C 4980 nt2.08□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.08□□□□□ -2.08
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