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Protein–RNA interactions for Protein: P38728
ECM34, Protein ECM34, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ECM34
P38728
YDR344C
YDR344C
444 nt
1.07
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
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YIL020C-A
339 nt
1.07
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
YKL136W
YKL136W
399 nt
1.07
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
HUG1
YML058W-A
207 nt
1.07
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
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YNL287W
2808 nt
1.07
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
SPO75
YLL005C
2607 nt
1.07
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
LCD1
YDR499W
2244 nt
1.07
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
MSH3
YCR092C
3057 nt
1.07
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
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YDL211C
1119 nt
1.06
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
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YGR008C
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□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
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YIL115W-A
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ECM34
P38728
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YPR063C
423 nt
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□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
SLI15
YBR156C
2097 nt
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□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
ALY2
YJL084C
3141 nt
1.06
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
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YKL033W
3117 nt
1.06
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
YGR130C
YGR130C
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1.06
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
OST1
YJL002C
1431 nt
1.06
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
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□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
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YER123W
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ECM34
P38728
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YCR020W-B
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1.05
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
RPL34B
YIL052C
366 nt
1.05
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
INA22
YIR024C
651 nt
1.05
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
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YMR290W-A
348 nt
1.05
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
APL3
YBL037W
3078 nt
1.05
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
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YBR206W
324 nt
1.04
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
SPT21
YMR179W
2277 nt
1.03
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
YDR521W
YDR521W
336 nt
1.03
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
YPR010C-A
YPR010C-A
219 nt
1.03
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
STE5
YDR103W
2754 nt
1.03
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
SWI4
YER111C
3282 nt
1.03
□□□□□ -2.24
ECM34
P38728
SET3
YKR029C
2256 nt
1.03
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
AZF1
YOR113W
2745 nt
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□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
PIP2
YOR363C
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1.02
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
IFH1
YLR223C
3258 nt
1.02
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
YJL015C
YJL015C
285 nt
1.02
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
SIP4
YJL089W
2490 nt
1.01
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
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YJL207C
6045 nt
1.01
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
ROM2
YLR371W
4071 nt
1.01
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
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YJL120W
324 nt
1.01
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
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YNL146W
303 nt
1.01
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
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YOR161W-B
261 nt
1.01
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
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105 nt
1.01
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
NST1
YNL091W
3723 nt
1.01
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
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YLL054C
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1
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
PKH2
YOL100W
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1
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
NUP145
YGL092W
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1
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
tV(UAC)B
tV(UAC)B
74 nt
1
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
tV(UAC)D
tV(UAC)D
74 nt
1
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
YIR044C
YIR044C
186 nt
1
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
YMR193C-A
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387 nt
1
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
SPO21
YOL091W
1830 nt
1
□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
STB6
YKL072W
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ECM34
P38728
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YDL206W
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□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
STO1
YMR125W
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□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
MSN5
YDR335W
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□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
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ECM34
P38728
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YIL032C
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ECM34
P38728
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YLL020C
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ECM34
P38728
EAF1
YDR359C
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ECM34
P38728
YLL007C
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ECM34
P38728
FIG4
YNL325C
2640 nt
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□□□□□ -2.25
ECM34
P38728
snR60
snR60
104 nt
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ECM34
P38728
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YGL149W
306 nt
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ECM34
P38728
RPL39
YJL189W
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ECM34
P38728
CUL3
YGR003W
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ECM34
P38728
RAD9
YDR217C
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ECM34
P38728
GPG1
YGL121C
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ECM34
P38728
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ECM34
P38728
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ECM34
P38728
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YBR064W
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ECM34
P38728
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YAR009C
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ECM34
P38728
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P38728
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P38728
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P38728
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P38728
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YOR015W
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P38728
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YPR137C-B
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snR65
snR65
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P38728
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P38728
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P38728
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P38728
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YNR010W
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YBR200W-A
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P38728
NUP157
YER105C
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P38728
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□□□□□ -2.27
ECM34
P38728
YMR321C
YMR321C
318 nt
0.9
□□□□□ -2.27
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