Protein–RNA interactions for Protein: P36070

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, yeastyeast

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3P36070 FIG4YNL325C 2640 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN3P36070 YLR422WYLR422W 5799 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN3P36070 NUP145YGL092W 3954 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN3P36070 FIG2YCR089W 4830 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN3P36070 YPR063CYPR063C 423 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN3P36070 YLL007CYLL007C 1998 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN3P36070 SEC3YER008C 4011 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN3P36070 APL3YBL037W 3078 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN3P36070 NHP2YDL208W 471 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN3P36070 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN3P36070 YDL206WYDL206W 2289 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN3P36070 CDC25YLR310C 4770 nt1.43□□□□□ -2.18
RRN3P36070 YCK3YER123W 1575 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN3P36070 SET3YKR029C 2256 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN3P36070 FYV8YGR196C 2454 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN3P36070 HTL1YCR020W-B 237 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN3P36070 YDR413CYDR413C 576 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN3P36070 YFL032WYFL032W 321 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN3P36070 NUP192YJL039C 5052 nt1.42□□□□□ -2.18
RRN3P36070 PAN2YGL094C 3348 nt1.41□□□□□ -2.18
RRN3P36070 CDC31YOR257W 486 nt1.41□□□□□ -2.18
RRN3P36070 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.41□□□□□ -2.18
RRN3P36070 SLD3YGL113W 2007 nt1.4□□□□□ -2.18
RRN3P36070 PDE2YOR360C 1581 nt1.4□□□□□ -2.19
RRN3P36070 HMRA2YCR096C 360 nt1.4□□□□□ -2.19
RRN3P36070 RPL39YJL189W 156 nt1.4□□□□□ -2.19
RRN3P36070 PBY1YBR094W 2262 nt1.4□□□□□ -2.19
RRN3P36070 DBP6YNR038W 1890 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN3P36070 ROM2YLR371W 4071 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN3P36070 STO1YMR125W 2586 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN3P36070 CDC36YDL165W 576 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN3P36070 YER097WYER097W 330 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN3P36070 CAT8YMR280C 4302 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN3P36070 YDR521WYDR521W 336 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN3P36070 YFL063WYFL063W 456 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN3P36070 RAD9YDR217C 3930 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN3P36070 MDS3YGL197W 4464 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN3P36070 YGL149WYGL149W 306 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN3P36070 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN3P36070 EAF1YDR359C 2949 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN3P36070 YAR009CYAR009C 3591 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN3P36070 SSS1YDR086C 243 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN3P36070 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.35□□□□□ -2.19
RRN3P36070 STB6YKL072W 2301 nt1.35□□□□□ -2.19
RRN3P36070 STE5YDR103W 2754 nt1.34□□□□□ -2.19
RRN3P36070 SPO75YLL005C 2607 nt1.34□□□□□ -2.19
RRN3P36070 YIL032CYIL032C 357 nt1.34□□□□□ -2.19
RRN3P36070 AHC1YOR023C 1701 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN3P36070 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN3P36070 RPS25BYLR333C 327 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN3P36070 YJL120WYJL120W 324 nt1.32□□□□□ -2.2
RRN3P36070 YBR206WYBR206W 324 nt1.32□□□□□ -2.2
RRN3P36070 WAR1YML076C 2835 nt1.31□□□□□ -2.2
RRN3P36070 snR60snR60 104 nt1.31□□□□□ -2.2
RRN3P36070 YDR344CYDR344C 444 nt1.31□□□□□ -2.2
RRN3P36070 YHL042WYHL042W 453 nt1.31□□□□□ -2.2
RRN3P36070 YMR321CYMR321C 318 nt1.31□□□□□ -2.2
RRN3P36070 CDC39YCR093W 6327 nt1.31□□□□□ -2.2
RRN3P36070 NUP157YER105C 4176 nt1.3□□□□□ -2.2
RRN3P36070 ALG13YGL047W 609 nt1.3□□□□□ -2.2
RRN3P36070 SPO21YOL091W 1830 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN3P36070 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN3P36070 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN3P36070 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN3P36070 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN3P36070 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN3P36070 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN3P36070 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN3P36070 VIK1YPL253C 1944 nt1.27□□□□□ -2.21
RRN3P36070 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.27□□□□□ -2.21
RRN3P36070 RPL33BYOR234C 324 nt1.27□□□□□ -2.21
RRN3P36070 NST1YNL091W 3723 nt1.27□□□□□ -2.21
RRN3P36070 INA22YIR024C 651 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN3P36070 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN3P36070 SMC1YFL008W 3678 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN3P36070 LAA1YJL207C 6045 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN3P36070 COG8YML071C 1824 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN3P36070 RPS27BYHR021C 249 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN3P36070 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN3P36070 YNL146WYNL146W 303 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN3P36070 YOR218CYOR218C 420 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN3P36070 YBR064WYBR064W 429 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN3P36070 CSE2YNR010W 450 nt1.23□□□□□ -2.21
RRN3P36070 APL1YJR005W 2103 nt1.22□□□□□ -2.21
RRN3P36070 MSH3YCR092C 3057 nt1.21□□□□□ -2.21
RRN3P36070 OLI1Q0130 231 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN3P36070 ECM12YHR021W-A 456 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN3P36070 YNL028WYNL028W 318 nt1.2□□□□□ -2.22
RRN3P36070 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.19□□□□□ -2.22
RRN3P36070 GEA2YEL022W 4380 nt1.19□□□□□ -2.22
RRN3P36070 snR65snR65 100 nt1.18□□□□□ -2.22
RRN3P36070 YGR130CYGR130C 2451 nt1.17□□□□□ -2.22
RRN3P36070 RAD61YDR014W 1944 nt1.17□□□□□ -2.22
RRN3P36070 KAP120YPL125W 3099 nt1.17□□□□□ -2.22
RRN3P36070 ISD11YER048W-A 285 nt1.16□□□□□ -2.22
RRN3P36070 IES4YOR189W 351 nt1.16□□□□□ -2.22
RRN3P36070 YPL044CYPL044C 549 nt1.15□□□□□ -2.23
RRN3P36070 SGF11YPL047W 300 nt1.15□□□□□ -2.23
RRN3P36070 MCM10YIL150C 1716 nt1.15□□□□□ -2.23
RRN3P36070 PAA1YDR071C 576 nt1.14□□□□□ -2.23
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