Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL2P13500 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL2P13500 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCL2P13500 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCL2P13500 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCL2P13500 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCL2P13500 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCL2P13500 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCL2P13500 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms