Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms