Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
BHLHA9Q7RTU4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms