Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOHLH1Q5JUK2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOHLH1Q5JUK2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms