Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 YLR252WYLR252W 306 nt-0.03□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.03□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 FYV10YIL097W 1551 nt-0.03□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 NIP100YPL174C 2607 nt-0.03□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 QCR7YDR529C 384 nt-0.03□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 YOL106WYOL106W 354 nt-0.03□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 RPB10YOR210W 213 nt-0.03□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 MLP1YKR095W 5628 nt-0.04□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 VMA21YGR105W 234 nt-0.04□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.04□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 snR190snR190 190 nt-0.04□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 PAN3YKL025C 2040 nt-0.04□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 ASE1YOR058C 2658 nt-0.05□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 RPC10YHR143W-A 213 nt-0.05□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 YGR164WYGR164W 336 nt-0.06□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.06□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.06□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 CSM4YPL200W 471 nt-0.06□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.06□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 RCO1YMR075W 2055 nt-0.07□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.07□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 PET111YMR257C 2403 nt-0.08□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 RPL22BYFL034C-A 369 nt-0.08□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 TDA2YER071C 381 nt-0.09□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 MRPL31YKL138C 396 nt-0.09□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 YLR232WYLR232W 348 nt-0.09□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.09□□□□□ -2.42
YPK9Q12697 VIK1YPL253C 1944 nt-0.11□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 COX12YLR038C 252 nt-0.11□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 RPL26AYLR344W 384 nt-0.11□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 COX7YMR256C 183 nt-0.11□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 TFB6YOR352W 1032 nt-0.11□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YOR364WYOR364W 369 nt-0.11□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 NPC2YDL046W 522 nt-0.12□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.12□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YFR057WYFR057W 456 nt-0.12□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 GPG1YGL121C 381 nt-0.12□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 LRP1YHR081W 555 nt-0.12□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.12□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YPL197CYPL197C 414 nt-0.12□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 PRP5YBR237W 2550 nt-0.12□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 LOC1YFR001W 615 nt-0.13□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 BSC3YLR465C 309 nt-0.13□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YCL002CYCL002C 792 nt-0.13□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 RFX1YLR176C 2436 nt-0.14□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 IPI3YNL182C 1668 nt-0.14□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 RPL35AYDL191W 363 nt-0.14□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YLR271WYLR271W 825 nt-0.14□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.15□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 RAD34YDR314C 2079 nt-0.15□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 HTB1YDR224C 396 nt-0.16□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YDR344CYDR344C 444 nt-0.16□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.16□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 RPS27AYKL156W 249 nt-0.16□□□□□ -2.43
YPK9Q12697 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.16□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 SSS1YDR086C 243 nt-0.16□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.16□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YBR064WYBR064W 429 nt-0.16□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 BI4Q0120 1917 nt-0.17□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.17□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.17□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 POL32YJR043C 1053 nt-0.17□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YJR079WYJR079W 330 nt-0.17□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YBR071WYBR071W 636 nt-0.17□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.18□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YPL185WYPL185W 396 nt-0.18□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 ORC3YLL004W 1851 nt-0.18□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 PRP42YDR235W 1635 nt-0.19□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 SDS22YKL193C 1017 nt-0.19□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-0.19□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 INP2YMR163C 2118 nt-0.2□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 SOV1YMR066W 2697 nt-0.2□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 LIN1YHR156C 1023 nt-0.2□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YNL050CYNL050C 813 nt-0.2□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.21□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YOR248WYOR248W 303 nt-0.21□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 CUP1-1YHR053C 186 nt-0.22□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 CUP1-2YHR055C 186 nt-0.22□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YJL135WYJL135W 318 nt-0.22□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YKL111CYKL111C 336 nt-0.22□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.22□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 MCM10YIL150C 1716 nt-0.22□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 RRI2YOL117W 1938 nt-0.22□□□□□ -2.44
YPK9Q12697 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.22□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 COX5BYIL111W 456 nt-0.22□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.22□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 CDC33YOL139C 642 nt-0.22□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 YPL044CYPL044C 549 nt-0.22□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 snR46snR46 197 nt-0.22□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 OST4YDL232W 111 nt-0.23□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 EMC4YGL231C 573 nt-0.23□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-0.23□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 RPS26AYGL189C 360 nt-0.24□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 PRP21YJL203W 843 nt-0.24□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 YOL160WYOL160W 342 nt-0.24□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 RSM23YGL129C 1353 nt-0.25□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.25□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 LEE1YPL054W 906 nt-0.25□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 YDR029WYDR029W 315 nt-0.26□□□□□ -2.45
YPK9Q12697 YPR096CYPR096C 303 nt-0.26□□□□□ -2.45
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