Protein–RNA interactions for Protein: Q12404

MPD1, Protein disulfide-isomerase MPD1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MPD1Q12404 YPR039WYPR039W 336 nt0.42□□□□□ -2.34
MPD1Q12404 YLL007CYLL007C 1998 nt0.42□□□□□ -2.34
MPD1Q12404 PRP16YKR086W 3216 nt0.42□□□□□ -2.34
MPD1Q12404 COG4YPR105C 2586 nt0.42□□□□□ -2.34
MPD1Q12404 BFR2YDR299W 1605 nt0.41□□□□□ -2.34
MPD1Q12404 ILM1YJR118C 612 nt0.39□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 YOL029CYOL029C 606 nt0.38□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 RCN2YOR220W 798 nt0.38□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 IRC16YPR038W 360 nt0.38□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 YDR269CYDR269C 324 nt0.36□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 APQ13YJL075C 417 nt0.36□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 YLR198CYLR198C 360 nt0.36□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 GRX5YPL059W 453 nt0.36□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 FMP27YLR454W 7887 nt0.35□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 ULP2YIL031W 3105 nt0.35□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 RPL9AYGL147C 576 nt0.35□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 YIL029CYIL029C 429 nt0.35□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 YOR282WYOR282W 321 nt0.35□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 PAN2YGL094C 3348 nt0.35□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 ZIP2YGL249W 2115 nt0.35□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 CHS6YJL099W 2241 nt0.34□□□□□ -2.35
MPD1Q12404 PMP1YCR024C-A 123 nt0.34□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 GPG1YGL121C 381 nt0.34□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YGL239CYGL239C 315 nt0.34□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 SPO11YHL022C 1197 nt0.34□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 LOA1YPR139C 903 nt0.34□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YHL042WYHL042W 453 nt0.33□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 PHS1YJL097W 654 nt0.33□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 PRP21YJL203W 843 nt0.33□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YNL050CYNL050C 813 nt0.33□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 DCP1YOL149W 696 nt0.33□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 NPR2YEL062W 1848 nt0.32□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 VMA21YGR105W 234 nt0.32□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.32□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YER135CYER135C 393 nt0.31□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 HUR1YGL168W 333 nt0.31□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.31□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YKL044WYKL044W 321 nt0.31□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 UTP20YBL004W 7482 nt0.31□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 NOP9YJL010C 2001 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 EFR3YMR212C 2349 nt0.3□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YDR344CYDR344C 444 nt0.29□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YJL135WYJL135W 318 nt0.29□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.29□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.29□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 PKH2YOL100W 3246 nt0.28□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.28□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 RPL26BYGR034W 384 nt0.28□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 RPS24BYIL069C 408 nt0.28□□□□□ -2.36
MPD1Q12404 YCK3YER123W 1575 nt0.28□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YGR025WYGR025W 303 nt0.27□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 ABF2YMR072W 552 nt0.27□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.27□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.27□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YSP1YHR155W 3687 nt0.27□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.26□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 UBX4YMR067C 1251 nt0.26□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 CDC33YOL139C 642 nt0.26□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 snR13snR13 124 nt0.26□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 SBH1YER087C-B 249 nt0.25□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 BER1YLR412W 825 nt0.25□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YDR029WYDR029W 315 nt0.24□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 RPL26AYLR344W 384 nt0.24□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 RPB10YOR210W 213 nt0.24□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 SVS1YPL163C 783 nt0.24□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YGR290WYGR290W 444 nt0.23□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YJR141WYJR141W 1044 nt0.23□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 RPS27AYKL156W 249 nt0.23□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 UBC7YMR022W 498 nt0.23□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 WIP1YDR374W-A 270 nt0.22□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.22□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 BSC3YLR465C 309 nt0.22□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.22□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 YPL044CYPL044C 549 nt0.22□□□□□ -2.37
MPD1Q12404 BIG1YHR101C 1008 nt0.21□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 Q0255Q0255 1419 nt0.21□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 TRS65YGR166W 1683 nt0.21□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 snR72snR72 98 nt0.2□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.2□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.2□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.19□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 AI1Q0050 2505 nt0.19□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.19□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.19□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.19□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 YKL202WYKL202W 582 nt0.19□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 YOL160WYOL160W 342 nt0.19□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 TSC3YBR058C-A 243 nt0.19□□□□□ -2.38
MPD1Q12404 YPL261CYPL261C 309 nt0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49 ms