Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 ZIP2YGL249W 2115 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 PCF11YDR228C 1881 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 NUP145YGL092W 3954 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 TRM732YMR259C 4263 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 RPB10YOR210W 213 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 snR14snR14 160 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 PRM3YPL192C 402 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YJR029WYJR029W 5268 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 MDS3YGL197W 4464 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 NPC2YDL046W 522 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 RPL26AYLR344W 384 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 AHC1YOR023C 1701 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 RAD9YDR217C 3930 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 ISF1YMR081C 1017 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 RRT1YBL048W 312 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YBR012CYBR012C 420 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 SLI15YBR156C 2097 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 ALY2YJL084C 3141 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 MAD1YGL086W 2250 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 AGA2YGL032C 264 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YNL058CYNL058C 951 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YPL261CYPL261C 309 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 APL3YBL037W 3078 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 MMS4YBR098W 2076 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 RPL33BYOR234C 324 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 snR51snR51 107 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 LCD1YDR499W 2244 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 YHL041WYHL041W 450 nt1.2□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 YLR434CYLR434C 384 nt1.2□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 YOL160WYOL160W 342 nt1.2□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 YGR042WYGR042W 816 nt1.19□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 ANS1YHR126C 480 nt1.19□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 YJL135WYJL135W 318 nt1.19□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 YJR003CYJR003C 1560 nt1.19□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 MSH3YCR092C 3057 nt1.18□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 EAF1YDR359C 2949 nt1.18□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 SWF1YDR126W 1011 nt1.18□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 YOL159CYOL159C 516 nt1.18□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 YOR199WYOR199W 330 nt1.18□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 ROM2YLR371W 4071 nt1.18□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 FIG4YNL325C 2640 nt1.17□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 INP2YMR163C 2118 nt1.17□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 SET3YKR029C 2256 nt1.17□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 STB6YKL072W 2301 nt1.16□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.16□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.16□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 COG4YPR105C 2586 nt1.16□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 PDE2YOR360C 1581 nt1.16□□□□□ -2.22
RPN5Q12250 snR72snR72 98 nt1.15□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 YER079WYER079W 633 nt1.15□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.15□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.15□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 RPL38YLR325C 237 nt1.14□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 YOR053WYOR053W 342 nt1.14□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 YBR285WYBR285W 435 nt1.14□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 STO1YMR125W 2586 nt1.13□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 RAD34YDR314C 2079 nt1.13□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 ATG31YDR022C 591 nt1.13□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 VAR1Q0140 1197 nt1.13□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 YIR044CYIR044C 186 nt1.13□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 BSC3YLR465C 309 nt1.13□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 NST1YNL091W 3723 nt1.13□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 GPG1YGL121C 381 nt1.12□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.12□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 PAC1YOR269W 1485 nt1.12□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 CDC39YCR093W 6327 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 PAN2YGL094C 3348 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 APL1YJR005W 2103 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 IFH1YLR223C 3258 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 LAA1YJL207C 6045 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 NUP157YER105C 4176 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 LEE1YPL054W 906 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 PKH2YOL100W 3246 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 SLD3YGL113W 2007 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 CUL3YGR003W 2235 nt1.09□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 YDL206WYDL206W 2289 nt1.09□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 YHR138CYHR138C 345 nt1.09□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.09□□□□□ -2.23
RPN5Q12250 SPO75YLL005C 2607 nt1.08□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.08□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 RPS20YHL015W 366 nt1.08□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.08□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.08□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 RIM20YOR275C 1986 nt1.08□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 YGR130CYGR130C 2451 nt1.07□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 SIP4YJL089W 2490 nt1.07□□□□□ -2.24
RPN5Q12250 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.07□□□□□ -2.24
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