Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 PDE2YOR360C 1581 nt1.95□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 RPL42BYHR141C 321 nt1.95□□□□□ -2.1 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.95□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 RPL42AYNL162W 321 nt1.95□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 UBP2YOR124C 3819 nt1.95□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 ZRG8YER033C 3231 nt1.95□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 RTT107YHR154W 3213 nt1.95□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.94□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 SPT21YMR179W 2277 nt1.94□□□□□ -2.1 RIP-Chip
PUF2Q12221 VPS8YAL002W 3825 nt1.94□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 SLM1YIL105C 2061 nt1.94□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 SWI6YLR182W 2412 nt1.94□□□□□ -2.1 RIP-Chip
PUF2Q12221 YCR043CYCR043C 384 nt1.94□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 RRT15YLR162W-A 189 nt1.94□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 VPS54YDR027C 2670 nt1.93□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 YJL135WYJL135W 318 nt1.93□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 YBL012CYBL012C 402 nt1.93□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 MPT5YGL178W 2580 nt1.93□□□□□ -2.1 RIP-Chip
PUF2Q12221 RFX1YLR176C 2436 nt1.92□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.92□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 YJL150WYJL150W 303 nt1.92□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.92□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 NOP14YDL148C 2433 nt1.91□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 NIP100YPL174C 2607 nt1.91□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 SIR4YDR227W 4077 nt1.91□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.91□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 OLI1Q0130 231 nt1.91□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.91□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.91□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 YNL338WYNL338W 159 nt1.91□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 YDR341CYDR341C 1824 nt1.9□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 ATP8Q0080 147 nt1.9□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YEL014CYEL014C 306 nt1.9□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 RPB10YOR210W 213 nt1.9□□□□□ -2.11 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR092WYPR092W 306 nt1.9□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 HER1YOR227W 3741 nt1.9□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 SWI5YDR146C 2130 nt1.9□□□□□ -2.11 RIP-Chip
PUF2Q12221 TRS65YGR166W 1683 nt1.9□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 SLY1YDR189W 2001 nt1.9□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 LYS14YDR034C 2373 nt1.9□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.89□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 snR72snR72 98 nt1.89□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.89□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 PAU18YLL064C 363 nt1.89□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 PAU6YNR076W 363 nt1.89□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 RPL37BYDR500C 267 nt1.88□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.88□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YLR140WYLR140W 327 nt1.88□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 PRP39YML046W 1890 nt1.88□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 CAT2YML042W 2013 nt1.88□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 PET309YLR067C 2898 nt1.88□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 FKS1YLR342W 5631 nt1.87□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 SYH1YPL105C 2550 nt1.87□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YOR376WYOR376W 369 nt1.87□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.87□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 SPC98YNL126W 2541 nt1.87□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 GCN2YDR283C 4980 nt1.87□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 SEC5YDR166C 2916 nt1.87□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 NAM7YMR080C 2916 nt1.87□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 snR74snR74 88 nt1.86□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YDL118WYDL118W 381 nt1.86□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.86□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.86□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YKU70YMR284W 1809 nt1.85□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 SPO75YLL005C 2607 nt1.85□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 SGF11YPL047W 300 nt1.85□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 YCL046WYCL046W 324 nt1.85□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 BUD2YKL092C 3315 nt1.85□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 PDR8YLR266C 2106 nt1.85□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 ATG9YDL149W 2994 nt1.85□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 RPS27BYHR021C 249 nt1.84□□□□□ -2.11
PUF2Q12221 MGA2YIR033W 3342 nt1.84□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 HSL1YKL101W 4557 nt1.84□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 YMR045CYMR045C 5268 nt1.83□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 YOR170WYOR170W 306 nt1.83□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 YOR218CYOR218C 420 nt1.83□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 KIP1YBL063W 3336 nt1.83□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 ZRG17YNR039C 1818 nt1.82□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.82□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.81□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 SRP14YDL092W 441 nt1.81□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.81□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 snR46snR46 197 nt1.81□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 YGL217CYGL217C 342 nt1.8□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 ENV11YGR071C 2583 nt1.8□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 HSH155YMR288W 2916 nt1.79□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 TMA7YLR262C-A 195 nt1.79□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 MSC6YOR354C 2079 nt1.78□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 TFC8YPL007C 1767 nt1.78□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.78□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 AGC1YPR021C 2709 nt1.78□□□□□ -2.12
PUF2Q12221 BPH1YCR032W 6504 nt1.78□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 HIR3YJR140C 4947 nt1.78□□□□□ -2.13 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPO21YOL091W 1830 nt1.77□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 FAB1YFR019W 6837 nt1.77□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 ECM12YHR021W-A 456 nt1.77□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 RPL34BYIL052C 366 nt1.77□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 YJL120WYJL120W 324 nt1.77□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 YNL170WYNL170W 396 nt1.77□□□□□ -2.13
PUF2Q12221 YBR174CYBR174C 315 nt1.77□□□□□ -2.13
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