Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 SSK2YNR031C 4740 nt1.47□□□□□ -2.17
SMF3Q12078 MVP1YMR004W 1536 nt1.46□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 RFX1YLR176C 2436 nt1.46□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 UPS1YLR193C 528 nt1.46□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.46□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 YOR376WYOR376W 369 nt1.46□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 YOP1YPR028W 543 nt1.46□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 CSN9YDR179C 489 nt1.45□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 RPL40BYKR094C 387 nt1.45□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 YAF9YNL107W 681 nt1.45□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 YLR419WYLR419W 4308 nt1.44□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 HKR1YDR420W 5409 nt1.44□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 AZF1YOR113W 2745 nt1.44□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.44□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 PET127YOR017W 2403 nt1.43□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 SRP14YDL092W 441 nt1.43□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 YDR102CYDR102C 333 nt1.43□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 RSM22YKL155C 1887 nt1.43□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 ZIP1YDR285W 2628 nt1.42□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.42□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.42□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 snR51snR51 107 nt1.42□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 MUK1YPL070W 1839 nt1.42□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 YLL032CYLL032C 2478 nt1.42□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 SEC5YDR166C 2916 nt1.41□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 SLY1YDR189W 2001 nt1.41□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 RPL35AYDL191W 363 nt1.41□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 RRT15YLR162W-A 189 nt1.41□□□□□ -2.18
SMF3Q12078 YKL118WYKL118W 312 nt1.4□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YKL136WYKL136W 399 nt1.4□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 RPL38YLR325C 237 nt1.4□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.4□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YSY6YBR162W-A 198 nt1.4□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 MSH3YCR092C 3057 nt1.4□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YLL054CYLL054C 2532 nt1.39□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 SMC4YLR086W 4257 nt1.39□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YJR011CYJR011C 786 nt1.39□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 ENV11YGR071C 2583 nt1.39□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 FYV8YGR196C 2454 nt1.39□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 RIM20YOR275C 1986 nt1.38□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 HTB2YBL002W 396 nt1.38□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 RPB10YOR210W 213 nt1.38□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 SEC3YER008C 4011 nt1.37□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 RAD50YNL250W 3939 nt1.37□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 INP2YMR163C 2118 nt1.37□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 PMD1YER132C 5262 nt1.37□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 NHP2YDL208W 471 nt1.37□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 PAU2YEL049W 363 nt1.37□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.37□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 VPS54YDR027C 2670 nt1.36□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YDR413CYDR413C 576 nt1.36□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YDR426CYDR426C 378 nt1.36□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 NUT1YGL151W 3399 nt1.36□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YGL217CYGL217C 342 nt1.36□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 snR36snR36 182 nt1.36□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 snR72snR72 98 nt1.35□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YDL211CYDL211C 1119 nt1.35□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.35□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YJL135WYJL135W 318 nt1.35□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 PCC1YKR095W-A 267 nt1.35□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 TAR1YLR154W-C 375 nt1.35□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YOR199WYOR199W 330 nt1.35□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YPR063CYPR063C 423 nt1.35□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 SLX4YLR135W 2247 nt1.35□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 APL2YKL135C 2181 nt1.34□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 PIK1YNL267W 3201 nt1.34□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 NPC2YDL046W 522 nt1.34□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.34□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.34□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YER097WYER097W 330 nt1.34□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YFL032WYFL032W 321 nt1.34□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 YOL160WYOL160W 342 nt1.34□□□□□ -2.19
SMF3Q12078 PIG1YLR273C 1947 nt1.34□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 SAS3YBL052C 2496 nt1.33□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.33□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 SWI4YER111C 3282 nt1.33□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 NOC3YLR002C 1992 nt1.32□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 YDR048CYDR048C 315 nt1.32□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 YNL146WYNL146W 303 nt1.32□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 TRM732YMR259C 4263 nt1.32□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 RAD9YDR217C 3930 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 LAA1YJL207C 6045 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 NIP100YPL174C 2607 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 YAR029WYAR029W 225 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 ZIP2YGL249W 2115 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.31□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 YLL020CYLL020C 306 nt1.3□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 YLR422WYLR422W 5799 nt1.3□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 MAD1YGL086W 2250 nt1.29□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 CDC36YDL165W 576 nt1.29□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.29□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 SDH2YLL041C 801 nt1.29□□□□□ -2.2
SMF3Q12078 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.29□□□□□ -2.2
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