Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 NOP9YJL010C 2001 nt0.34□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 RPS30BYOR182C 192 nt0.34□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 RCN2YOR220W 798 nt0.34□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 LOA1YPR139C 903 nt0.34□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 CHS6YJL099W 2241 nt0.33□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 SLI15YBR156C 2097 nt0.33□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 SPO11YHL022C 1197 nt0.33□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 YOR218CYOR218C 420 nt0.33□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 AFR1YDR085C 1863 nt0.33□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 ULP2YIL031W 3105 nt0.32□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 SEC8YPR055W 3198 nt0.32□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 NPC2YDL046W 522 nt0.32□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 SEM1YDR363W-A 270 nt0.32□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 YER135CYER135C 393 nt0.32□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 YPR039WYPR039W 336 nt0.32□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 IPP1YBR011C 864 nt0.31□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 YJR003CYJR003C 1560 nt0.31□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 APQ13YJL075C 417 nt0.3□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 AFB1YLR040C 675 nt0.3□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 IRC16YPR038W 360 nt0.3□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 GEA2YEL022W 4380 nt0.3□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 HUR1YGL168W 333 nt0.29□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 YOR282WYOR282W 321 nt0.29□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 STE5YDR103W 2754 nt0.28□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 BIR1YJR089W 2865 nt0.28□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 SLX9YGR081C 633 nt0.28□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 UBC7YMR022W 498 nt0.28□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 YOL029CYOL029C 606 nt0.28□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 PKH2YOL100W 3246 nt0.28□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 YDR269CYDR269C 324 nt0.27□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 RPL9AYGL147C 576 nt0.27□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 YGL239CYGL239C 315 nt0.27□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 PHS1YJL097W 654 nt0.27□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 YKL044WYKL044W 321 nt0.27□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 YIL029CYIL029C 429 nt0.26□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 HUG1YML058W-A 207 nt0.26□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 AI1Q0050 2505 nt0.25□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 YCK3YER123W 1575 nt0.25□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 YJL135WYJL135W 318 nt0.25□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 GRX5YPL059W 453 nt0.25□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 ZIP2YGL249W 2115 nt0.25□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 YNL050CYNL050C 813 nt0.24□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 NPR2YEL062W 1848 nt0.24□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 ASE1YOR058C 2658 nt0.23□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 GPG1YGL121C 381 nt0.23□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 RPS24BYIL069C 408 nt0.23□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 PRP21YJL203W 843 nt0.23□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 IQG1YPL242C 4488 nt0.23□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.22□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 ILM1YJR118C 612 nt0.22□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.22□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 YLR198CYLR198C 360 nt0.22□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 UBX4YMR067C 1251 nt0.22□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 BEM3YPL115C 3387 nt0.22□□□□□ -2.37
HRD1Q08109 VMA21YGR105W 234 nt0.21□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.21□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.21□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.21□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 snR13snR13 124 nt0.21□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YGR025WYGR025W 303 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.2□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 FYV10YIL097W 1551 nt0.19□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.19□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.19□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YOL160WYOL160W 342 nt0.19□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 SBH1YER087C-B 249 nt0.18□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 RPL26BYGR034W 384 nt0.18□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YJR141WYJR141W 1044 nt0.18□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YPL261CYPL261C 309 nt0.18□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 RAD34YDR314C 2079 nt0.17□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YDR344CYDR344C 444 nt0.17□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 PAU12YGR294W 363 nt0.17□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.17□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.17□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 BSC3YLR465C 309 nt0.17□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 DCP1YOL149W 696 nt0.17□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YBR064WYBR064W 429 nt0.17□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 RPL26AYLR344W 384 nt0.16□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 BER1YLR412W 825 nt0.16□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.16□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 EFR3YMR212C 2349 nt0.15□□□□□ -2.38
HRD1Q08109 BIG1YHR101C 1008 nt0.15□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YKL202WYKL202W 582 nt0.15□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.15□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YPL185WYPL185W 396 nt0.15□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 Q0255Q0255 1419 nt0.14□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YDL016CYDL016C 303 nt0.14□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.14□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.14□□□□□ -2.39
HRD1Q08109 CDC33YOL139C 642 nt0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms