Protein–RNA interactions for Protein: Q07527

TRM3, tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM3Q07527 CSM4YPL200W 471 nt0.46□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 RPL9AYGL147C 576 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 SDH2YLL041C 801 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 RPL38YLR325C 237 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 YPR153WYPR153W 423 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 YCL002CYCL002C 792 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.44□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 YBR071WYBR071W 636 nt0.44□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 LCD1YDR499W 2244 nt0.44□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 MMS4YBR098W 2076 nt0.43□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 YJR079WYJR079W 330 nt0.43□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 UPS1YLR193C 528 nt0.43□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.43□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 ECM12YHR021W-A 456 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 YOR248WYOR248W 303 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 UTP10YJL109C 5310 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 snR9snR9 187 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 ALG13YGL047W 609 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 MPC1YGL080W 393 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 MND1YGL183C 660 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 RRT1YBL048W 312 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 YGR042WYGR042W 816 nt0.4□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 GMC2YLR445W 567 nt0.4□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.4□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 IES4YOR189W 351 nt0.4□□□□□ -2.34
TRM3Q07527 DBP6YNR038W 1890 nt0.4□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 MET32YDR253C 576 nt0.39□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 ISD11YER048W-A 285 nt0.39□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 SCEIQ0160 708 nt0.39□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.39□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 YBR063CYBR063C 1215 nt0.39□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 YLL032CYLL032C 2478 nt0.39□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 YCR100CYCR100C 951 nt0.37□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 YDL187CYDL187C 330 nt0.37□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 MRPL31YKL138C 396 nt0.37□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 YMR254CYMR254C 309 nt0.37□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 BFR2YDR299W 1605 nt0.37□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.36□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 YAL066WYAL066W 309 nt0.36□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 RFX1YLR176C 2436 nt0.35□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 SLI15YBR156C 2097 nt0.35□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.35□□□□□ -2.35
TRM3Q07527 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.34□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 YHL042WYHL042W 453 nt0.34□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 ECM9YKR004C 1134 nt0.34□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 YLL007CYLL007C 1998 nt0.34□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 SPO11YHL022C 1197 nt0.33□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 YLR252WYLR252W 306 nt0.33□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 NNF2YGR089W 2811 nt0.32□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 NPC2YDL046W 522 nt0.32□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 RPL32YBL092W 393 nt0.32□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 YOR282WYOR282W 321 nt0.32□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 AFR1YDR085C 1863 nt0.32□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 YJR087WYJR087W 351 nt0.31□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 RCN2YOR220W 798 nt0.31□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 snR45snR45 172 nt0.31□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 CHS6YJL099W 2241 nt0.31□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 NOP9YJL010C 2001 nt0.31□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 PMP1YCR024C-A 123 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 ABF2YMR072W 552 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 YPR039WYPR039W 336 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 LOA1YPR139C 903 nt0.3□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 AFB1YLR040C 675 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 IPP1YBR011C 864 nt0.29□□□□□ -2.36
TRM3Q07527 YDR269CYDR269C 324 nt0.27□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 SEM1YDR363W-A 270 nt0.27□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 YOL029CYOL029C 606 nt0.27□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 IRC16YPR038W 360 nt0.26□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 ZIP2YGL249W 2115 nt0.26□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 NPR2YEL062W 1848 nt0.26□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 YER135CYER135C 393 nt0.25□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 GPG1YGL121C 381 nt0.25□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 YGL239CYGL239C 315 nt0.25□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 APQ13YJL075C 417 nt0.25□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 HUR1YGL168W 333 nt0.24□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 YIL029CYIL029C 429 nt0.23□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 YJL135WYJL135W 318 nt0.23□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.22□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.22□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 ILM1YJR118C 612 nt0.22□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 YAR053WYAR053W 297 nt0.22□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.22□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 ESP1YGR098C 4893 nt0.22□□□□□ -2.37
TRM3Q07527 RPS24BYIL069C 408 nt0.21□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 YKL044WYKL044W 321 nt0.21□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.21□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 snR13snR13 124 nt0.21□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 RPL26BYGR034W 384 nt0.2□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 PRP21YJL203W 843 nt0.19□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 YOL160WYOL160W 342 nt0.19□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 GRX5YPL059W 453 nt0.19□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 SBH1YER087C-B 249 nt0.18□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 VMA21YGR105W 234 nt0.18□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.18□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 RPL26AYLR344W 384 nt0.18□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 YNL050CYNL050C 813 nt0.18□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 YDR344CYDR344C 444 nt0.17□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 YGR025WYGR025W 303 nt0.17□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.17□□□□□ -2.38
TRM3Q07527 FYV10YIL097W 1551 nt0.17□□□□□ -2.38
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