Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 YNL122CYNL122C 348 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 FIG4YNL325C 2640 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 SLD3YGL113W 2007 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 STO1YMR125W 2586 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 EFR3YMR212C 2349 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 BI2Q0110 1272 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 STF2YGR008C 255 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 RPS27AYKL156W 249 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 RRT1YBL048W 312 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 CDC33YOL139C 642 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 MMS4YBR098W 2076 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YAR009CYAR009C 3591 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YPR117WYPR117W 7470 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 NPC2YDL046W 522 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 WIP1YDR374W-A 270 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 ZEO1YOL109W 342 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YOR199WYOR199W 330 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 PDE2YOR360C 1581 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 UBP3YER151C 2739 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 SLI15YBR156C 2097 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 TIM13YGR181W 318 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YGR290WYGR290W 444 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 HUG1YML058W-A 207 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YBL071CYBL071C 309 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 snR189snR189 189 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 AIM9YER080W 1884 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 COG4YPR105C 2586 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YDL011CYDL011C 324 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 ZIP2YGL249W 2115 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YKL202WYKL202W 582 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 snR54snR54 86 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YDL206WYDL206W 2289 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YJR003CYJR003C 1560 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 FYV7YLR068W 456 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 ERP4YOR016C 624 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 PAM16YJL104W 450 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YLR171WYLR171W 390 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YOR029WYOR029W 336 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YDL073WYDL073W 2955 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YDL196WYDL196W 330 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 ECL1YGR146C 636 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 DIE2YGR227W 1578 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YJL135WYJL135W 318 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YLR287CYLR287C 1068 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 PAU24YBR301W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 PAN2YGL094C 3348 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 RIM20YOR275C 1986 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YGR042WYGR042W 816 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YNL303WYNL303W 348 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 RPB10YOR210W 213 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 YPL261CYPL261C 309 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 WAR1YML076C 2835 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG39Q06159 UBC7YMR022W 498 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YOL160WYOL160W 342 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 LOA1YPR139C 903 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 PRP16YKR086W 3216 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 snR72snR72 98 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 CBS1YDL069C 690 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 GPG1YGL121C 381 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YLR101CYLR101C 396 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 PAC1YOR269W 1485 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 SWF1YDR126W 1011 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YHL042WYHL042W 453 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 TOM22YNL131W 459 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YPL229WYPL229W 621 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 snR51snR51 107 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 RAD34YDR314C 2079 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 SDH7YDR511W 402 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 snR41snR41 95 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 PKH2YOL100W 3246 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 ATP19YOL077W-A 207 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 RPS30BYOR182C 192 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 SEC1YDR164C 2175 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 MRPL50YNR022C 420 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YAP6YDR259C 1152 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 ISD11YER048W-A 285 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YHL041WYHL041W 450 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 YKL083WYKL083W 615 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG39Q06159 RKR1YMR247C 4689 nt0.59□□□□□ -2.32
ATG39Q06159 INP2YMR163C 2118 nt0.59□□□□□ -2.32
ATG39Q06159 DBP6YNR038W 1890 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG39Q06159 NHP2YDL208W 471 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG39Q06159 ALG13YGL047W 609 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG39Q06159 YIR044CYIR044C 186 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG39Q06159 RPL26AYLR344W 384 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG39Q06159 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG39Q06159 YDR521WYDR521W 336 nt0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.2 ms