Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.49□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 ISW1YBR245C 3390 nt2.49□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 UBP2YOR124C 3819 nt2.49□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 TUS1YLR425W 3924 nt2.48□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 ULI1YFR026C 510 nt2.48□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 TFC8YPL007C 1767 nt2.48□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 MSC6YOR354C 2079 nt2.48□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 UTP22YGR090W 3714 nt2.47□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 TOP2YNL088W 4287 nt2.47□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 SGM1YJR134C 2124 nt2.47□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 PSD2YGR170W 3417 nt2.47□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.47□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 ELG1YOR144C 2376 nt2.47□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 SPC98YNL126W 2541 nt2.47□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 NUP100YKL068W 2880 nt2.47□□□□□ -2.01
HRQ1Q05549 SPP41YDR464W 4308 nt2.46□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 snR46snR46 197 nt2.46□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 snR52snR52 92 nt2.46□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 DCP2YNL118C 2913 nt2.46□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 MNE1YOR350C 1992 nt2.45□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 FAR11YNL127W 2862 nt2.45□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 ZRG17YNR039C 1818 nt2.45□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 SDH6YDR379C-A 240 nt2.45□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 ECM12YHR021W-A 456 nt2.45□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 RPS29AYLR388W 171 nt2.45□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.45□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 YCL046WYCL046W 324 nt2.45□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 SIR3YLR442C 2937 nt2.45□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 MET18YIL128W 3099 nt2.44□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 VPS8YAL002W 3825 nt2.44□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 LRE1YCL051W 1752 nt2.44□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 ZIP1YDR285W 2628 nt2.43□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 STH1YIL126W 4080 nt2.43□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 Q0143Q0143 153 nt2.43□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.43□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 ORC2YBR060C 1863 nt2.43□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 BRE1YDL074C 2103 nt2.42□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 UBP1YDL122W 2430 nt2.42□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 SEC16YPL085W 6588 nt2.42□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.42□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.42□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 SPO75YLL005C 2607 nt2.42□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 SAS3YBL052C 2496 nt2.42□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 NOP14YDL148C 2433 nt2.41□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 PUT3YKL015W 2940 nt2.41□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 RPL34BYIL052C 366 nt2.41□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.41□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 RLM1YPL089C 2031 nt2.41□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 NEO1YIL048W 3456 nt2.4□□□□□ -2.02
HRQ1Q05549 ZIP2YGL249W 2115 nt2.4□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.4□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 EDS1YBR033W 2760 nt2.4□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 YGR164WYGR164W 336 nt2.39□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.39□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 YBR174CYBR174C 315 nt2.39□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 MAK10YEL053C 2202 nt2.39□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.38□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 RPS25BYLR333C 327 nt2.38□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 UBR1YGR184C 5853 nt2.38□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 RAV1YJR033C 4074 nt2.37□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 SPO21YOL091W 1830 nt2.37□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 KRE33YNL132W 3171 nt2.36□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 VTC1YER072W 390 nt2.36□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 RAD34YDR314C 2079 nt2.36□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 TOR1YJR066W 7413 nt2.36□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 SIR4YDR227W 4077 nt2.35□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 ATP7YKL016C 525 nt2.35□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 COF1YLL050C 432 nt2.35□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 RPS17AYML024W 411 nt2.35□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 NAM7YMR080C 2916 nt2.35□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 HSH155YMR288W 2916 nt2.34□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 YEL073CYEL073C 324 nt2.34□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 BRP1YGL007W 378 nt2.34□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 YJL120WYJL120W 324 nt2.34□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.34□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 CDC60YPL160W 3273 nt2.34□□□□□ -2.03
HRQ1Q05549 TRL1YJL087C 2484 nt2.34□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 MAD1YGL086W 2250 nt2.33□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 YIR044CYIR044C 186 nt2.33□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 YDR341CYDR341C 1824 nt2.33□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 ENV11YGR071C 2583 nt2.32□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 APL2YKL135C 2181 nt2.32□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 BNI1YNL271C 5862 nt2.31□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 YLL007CYLL007C 1998 nt2.31□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 NOC3YLR002C 1992 nt2.31□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 PET309YLR067C 2898 nt2.31□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 MLH3YPL164C 2148 nt2.31□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 NCA2YPR155C 1851 nt2.31□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 CAT2YML042W 2013 nt2.3□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 YDL118WYDL118W 381 nt2.3□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 RPL33BYOR234C 324 nt2.3□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 YOR345CYOR345C 351 nt2.3□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 CUL3YGR003W 2235 nt2.3□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 PTP2YOR208W 2253 nt2.29□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 HMI1YOL095C 2121 nt2.29□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 YNL205CYNL205C 423 nt2.29□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 ATG11YPR049C 3537 nt2.29□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 BUD2YKL092C 3315 nt2.29□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 SYH1YPL105C 2550 nt2.29□□□□□ -2.04
HRQ1Q05549 MSH5YDL154W 2706 nt2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 120.5 ms