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Protein–RNA interactions for Protein: Q03048
COF1, Cofilin, yeast
Known RBP
Predictions only
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143 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
COF1
Q03048
CDC33
YOL139C
642 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YOR108C-A
YOR108C-A
210 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YER076W-A
YER076W-A
348 nt
0.01
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
STF2
YGR008C
255 nt
0.01
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YJL127W-A
YJL127W-A
117 nt
0.01
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
CMC1
YKL137W
336 nt
0.01
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
COX12
YLR038C
252 nt
0.01
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YLR217W
YLR217W
324 nt
0.01
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YER188C-A
YER188C-A
300 nt
0
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
RFX1
YLR176C
2436 nt
0
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
BSC3
YLR465C
309 nt
0
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
UBC7
YMR022W
498 nt
0
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YBL062W
YBL062W
381 nt
0
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
CSM4
YPL200W
471 nt
0
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
IQG1
YPL242C
4488 nt
0
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YGR290W
YGR290W
444 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
SPO13
YHR014W
876 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
BIG1
YHR101C
1008 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
VAM3
YOR106W
852 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
VIK1
YPL253C
1944 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YER138W-A
YER138W-A
105 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YGL015C
YGL015C
393 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YJR079W
YJR079W
330 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YLR271W
YLR271W
825 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
BUD26
YDR241W
288 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
ZIP2
YGL249W
2115 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
VMA21
YGR105W
234 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
YPR096C
YPR096C
303 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
COF1
Q03048
CWC23
YGL128C
852 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
SDS22
YKL193C
1017 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YLR412C-A
YLR412C-A
207 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
HUG1
YML058W-A
207 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
FYV10
YIL097W
1551 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YOR192C-B
YOR192C-B
5313 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
PKH2
YOL100W
3246 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
snR5
snR5
204 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
snR13
snR13
124 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YPL044C
YPL044C
549 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
SLX9
YGR081C
633 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
RCN2
YOR220W
798 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
BIR1
YJR089W
2865 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YOL014W
YOL014W
375 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YOR053W
YOR053W
342 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
INP2
YMR163C
2118 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
PRP5
YBR237W
2550 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YDR269C
YDR269C
324 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YGR228W
YGR228W
345 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YBL107W-A
YBL107W-A
105 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
CUL3
YGR003W
2235 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YJL135W
YJL135W
318 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YOR248W
YOR248W
303 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
PRP42
YDR235W
1635 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
COF1
Q03048
YER078W-A
YER078W-A
165 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YCL002C
YCL002C
792 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
MCM10
YIL150C
1716 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
SEC8
YPR055W
3198 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YMR290W-A
YMR290W-A
348 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YNL050C
YNL050C
813 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YBR064W
YBR064W
429 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
IRC16
YPR038W
360 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
snR190
snR190
190 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
ILM1
YJR118C
612 nt
-0.12
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
ORC3
YLL004W
1851 nt
-0.12
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
COG8
YML071C
1824 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
STE5
YDR103W
2754 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
SSS1
YDR086C
243 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
OLI1
Q0130
231 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YGR115C
YGR115C
780 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YIR018C-A
YIR018C-A
138 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YLR198C
YLR198C
360 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YLR232W
YLR232W
348 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
MRPL50
YNR022C
420 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
PHS1
YJL097W
654 nt
-0.14
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
EFR3
YMR212C
2349 nt
-0.14
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
RCO1
YMR075W
2055 nt
-0.15
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
PRP21
YJL203W
843 nt
-0.15
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YMR141W-A
YMR141W-A
225 nt
-0.15
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YMR254C
YMR254C
309 nt
-0.15
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
RPB10
YOR210W
213 nt
-0.15
□□□□□ -2.43
COF1
Q03048
YFR012W-A
YFR012W-A
87 nt
-0.16
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
YBL008W-A
YBL008W-A
240 nt
-0.16
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
LEE1
YPL054W
906 nt
-0.16
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
YPR039W
YPR039W
336 nt
-0.16
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
POP7
YBR167C
423 nt
-0.16
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
snR45
snR45
172 nt
-0.16
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
MYO1
YHR023W
5787 nt
-0.17
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
RPL35A
YDL191W
363 nt
-0.17
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
OST4
YDL232W
111 nt
-0.17
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
COX5B
YIL111W
456 nt
-0.17
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
RPS27A
YKL156W
249 nt
-0.17
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
YBR076C-A
YBR076C-A
267 nt
-0.17
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
YDR029W
YDR029W
315 nt
-0.18
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
YDR371C-A
YDR371C-A
105 nt
-0.18
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
YGL239C
YGL239C
315 nt
-0.18
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
YIR021W-A
YIR021W-A
213 nt
-0.18
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
YKL068W-A
YKL068W-A
237 nt
-0.18
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
YBR063C
YBR063C
1215 nt
-0.18
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
MRPL32
YCR003W
552 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
snR72
snR72
98 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
COF1
Q03048
snR9
snR9
187 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
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