Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00205P59089 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms