Protein–RNA interactions for Protein: P53900

GIM3, Prefoldin subunit 4, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM3P53900 MRPS8YMR158W 468 nt0.27□□□□□ -2.37
GIM3P53900 PPN1YDR452W 2025 nt0.26□□□□□ -2.37
GIM3P53900 ESP1YGR098C 4893 nt0.26□□□□□ -2.37
GIM3P53900 MND1YGL183C 660 nt0.26□□□□□ -2.37
GIM3P53900 YBR063CYBR063C 1215 nt0.26□□□□□ -2.37
GIM3P53900 snR9snR9 187 nt0.25□□□□□ -2.37
GIM3P53900 SPO13YHR014W 876 nt0.25□□□□□ -2.37
GIM3P53900 RPS24BYIL069C 408 nt0.25□□□□□ -2.37
GIM3P53900 SCEIQ0160 708 nt0.24□□□□□ -2.37
GIM3P53900 YLR252WYLR252W 306 nt0.24□□□□□ -2.37
GIM3P53900 YCK3YER123W 1575 nt0.23□□□□□ -2.37
GIM3P53900 MLP1YKR095W 5628 nt0.23□□□□□ -2.37
GIM3P53900 APQ13YJL075C 417 nt0.23□□□□□ -2.37
GIM3P53900 UBC7YMR022W 498 nt0.23□□□□□ -2.37
GIM3P53900 ZIP2YGL249W 2115 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM3P53900 YDR269CYDR269C 324 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM3P53900 SBH1YER087C-B 249 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM3P53900 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM3P53900 PAU12YGR294W 363 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM3P53900 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM3P53900 RPL26BYGR034W 384 nt0.21□□□□□ -2.38
GIM3P53900 YDL187CYDL187C 330 nt0.2□□□□□ -2.38
GIM3P53900 ECM9YKR004C 1134 nt0.2□□□□□ -2.38
GIM3P53900 AFB1YLR040C 675 nt0.2□□□□□ -2.38
GIM3P53900 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.2□□□□□ -2.38
GIM3P53900 ULP2YIL031W 3105 nt0.19□□□□□ -2.38
GIM3P53900 YPR039WYPR039W 336 nt0.19□□□□□ -2.38
GIM3P53900 SEC8YPR055W 3198 nt0.19□□□□□ -2.38
GIM3P53900 UBX4YMR067C 1251 nt0.18□□□□□ -2.38
GIM3P53900 YMR254CYMR254C 309 nt0.18□□□□□ -2.38
GIM3P53900 YGL239CYGL239C 315 nt0.17□□□□□ -2.38
GIM3P53900 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.17□□□□□ -2.38
GIM3P53900 UTP20YBL004W 7482 nt0.17□□□□□ -2.38
GIM3P53900 PHS1YJL097W 654 nt0.16□□□□□ -2.38
GIM3P53900 YJL135WYJL135W 318 nt0.16□□□□□ -2.38
GIM3P53900 AFR1YDR085C 1863 nt0.16□□□□□ -2.38
GIM3P53900 ILM1YJR118C 612 nt0.15□□□□□ -2.39
GIM3P53900 TRS65YGR166W 1683 nt0.14□□□□□ -2.39
GIM3P53900 MPC1YGL080W 393 nt0.14□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.14□□□□□ -2.39
GIM3P53900 BSC3YLR465C 309 nt0.14□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.14□□□□□ -2.39
GIM3P53900 RPS30BYOR182C 192 nt0.14□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YPL044CYPL044C 549 nt0.14□□□□□ -2.39
GIM3P53900 IRC16YPR038W 360 nt0.14□□□□□ -2.39
GIM3P53900 FYV10YIL097W 1551 nt0.14□□□□□ -2.39
GIM3P53900 PKH2YOL100W 3246 nt0.12□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YDR344CYDR344C 444 nt0.12□□□□□ -2.39
GIM3P53900 AI1Q0050 2505 nt0.12□□□□□ -2.39
GIM3P53900 PET111YMR257C 2403 nt0.12□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YJR087WYJR087W 351 nt0.11□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.11□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YPL185WYPL185W 396 nt0.11□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.11□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YCR100CYCR100C 951 nt0.1□□□□□ -2.39
GIM3P53900 CDC33YOL139C 642 nt0.1□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YPL261CYPL261C 309 nt0.1□□□□□ -2.39
GIM3P53900 VIK1YPL253C 1944 nt0.1□□□□□ -2.39
GIM3P53900 YAL066WYAL066W 309 nt0.09□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YNL050CYNL050C 813 nt0.09□□□□□ -2.4
GIM3P53900 EFR3YMR212C 2349 nt0.09□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.08□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.08□□□□□ -2.4
GIM3P53900 SLX9YGR081C 633 nt0.07□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YOL160WYOL160W 342 nt0.07□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YER135CYER135C 393 nt0.06□□□□□ -2.4
GIM3P53900 BIG1YHR101C 1008 nt0.06□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.06□□□□□ -2.4
GIM3P53900 HUR1YGL168W 333 nt0.05□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YIL029CYIL029C 429 nt0.05□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YIR044CYIR044C 186 nt0.05□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YOL029CYOL029C 606 nt0.05□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YKL202WYKL202W 582 nt0.04□□□□□ -2.4
GIM3P53900 COX12YLR038C 252 nt0.04□□□□□ -2.4
GIM3P53900 RAD34YDR314C 2079 nt0.04□□□□□ -2.4
GIM3P53900 INP2YMR163C 2118 nt0.04□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.03□□□□□ -2.4
GIM3P53900 HAL9YOL089C 3093 nt0.03□□□□□ -2.4
GIM3P53900 STF2YGR008C 255 nt0.03□□□□□ -2.4
GIM3P53900 VMA21YGR105W 234 nt0.03□□□□□ -2.4
GIM3P53900 IPP1YBR011C 864 nt0.03□□□□□ -2.4
GIM3P53900 ASE1YOR058C 2658 nt0.03□□□□□ -2.4
GIM3P53900 YBR064WYBR064W 429 nt0.02□□□□□ -2.41
GIM3P53900 BIR1YJR089W 2865 nt0.02□□□□□ -2.41
GIM3P53900 YKL044WYKL044W 321 nt0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 YGR290WYGR290W 444 nt0□□□□□ -2.41
GIM3P53900 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0□□□□□ -2.41
GIM3P53900 YDR029WYDR029W 315 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 WIP1YDR374W-A 270 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 PRP21YJL203W 843 nt-0.01□□□□□ -2.41
GIM3P53900 RPS27AYKL156W 249 nt-0.01□□□□□ -2.41
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