Protein–RNA interactions for Protein: P47078

YJL009W, Uncharacterized protein YJL009W, yeastyeast

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL009WP47078 YCK3YER123W 1575 nt0.19□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 MND1YGL183C 660 nt0.19□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 SCEIQ0160 708 nt0.19□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 RPS24BYIL069C 408 nt0.19□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.19□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 YOR248WYOR248W 303 nt0.19□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 RFX1YLR176C 2436 nt0.18□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 STE5YDR103W 2754 nt0.18□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 ULP2YIL031W 3105 nt0.18□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 NPC2YDL046W 522 nt0.18□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 YER135CYER135C 393 nt0.18□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 UBC7YMR022W 498 nt0.18□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 YMR254CYMR254C 309 nt0.18□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 YCL002CYCL002C 792 nt0.18□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 YBR063CYBR063C 1215 nt0.17□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 IRC16YPR038W 360 nt0.17□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 NPR2YEL062W 1848 nt0.17□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 YDL187CYDL187C 330 nt0.16□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 snR9snR9 187 nt0.16□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 WIP1YDR374W-A 270 nt0.16□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.16□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 UBX4YMR067C 1251 nt0.16□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.16□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 BEM3YPL115C 3387 nt0.16□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 PPN1YDR452W 2025 nt0.16□□□□□ -2.38
YJL009WP47078 TRS65YGR166W 1683 nt0.15□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YGL230CYGL230C 444 nt0.15□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 RPL26BYGR034W 384 nt0.15□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 PAU12YGR294W 363 nt0.15□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 SPO13YHR014W 876 nt0.15□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YOR282WYOR282W 321 nt0.15□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 ASE1YOR058C 2658 nt0.15□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 AI1Q0050 2505 nt0.15□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.14□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 SEC8YPR055W 3198 nt0.14□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YCR100CYCR100C 951 nt0.14□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 SBH1YER087C-B 249 nt0.14□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 RPL9AYGL147C 576 nt0.14□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 RCN2YOR220W 798 nt0.14□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YDR344CYDR344C 444 nt0.13□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YJR087WYJR087W 351 nt0.13□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YLR252WYLR252W 306 nt0.13□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.13□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 MRPS8YMR158W 468 nt0.13□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 HUR1YGL168W 333 nt0.12□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YJL135WYJL135W 318 nt0.12□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YPR039WYPR039W 336 nt0.12□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 PKH2YOL100W 3246 nt0.12□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 FYV10YIL097W 1551 nt0.11□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YDR269CYDR269C 324 nt0.11□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.11□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.11□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 PHS1YJL097W 654 nt0.11□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YOL014WYOL014W 375 nt0.11□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 ZIP2YGL249W 2115 nt0.1□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 GPG1YGL121C 381 nt0.1□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 ECM9YKR004C 1134 nt0.1□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 BSC3YLR465C 309 nt0.1□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 YBR064WYBR064W 429 nt0.1□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 AFR1YDR085C 1863 nt0.1□□□□□ -2.39
YJL009WP47078 BIG1YHR101C 1008 nt0.09□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YAL066WYAL066W 309 nt0.09□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.09□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 MCM10YIL150C 1716 nt0.08□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YGL239CYGL239C 315 nt0.08□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 VMA21YGR105W 234 nt0.07□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 QCR9YGR183C 201 nt0.07□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YGR290WYGR290W 444 nt0.07□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 APQ13YJL075C 417 nt0.07□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.07□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.07□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.07□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YOL029CYOL029C 606 nt0.07□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.07□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 IQG1YPL242C 4488 nt0.07□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.06□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 MPC1YGL080W 393 nt0.06□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.06□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.05□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YKL044WYKL044W 321 nt0.05□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 AFB1YLR040C 675 nt0.05□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YLR198CYLR198C 360 nt0.05□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 CDC33YOL139C 642 nt0.05□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YOL160WYOL160W 342 nt0.05□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 IPP1YBR011C 864 nt0.05□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.05□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 PET111YMR257C 2403 nt0.04□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YNL050CYNL050C 813 nt0.04□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 RAD34YDR314C 2079 nt0.04□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YGR025WYGR025W 303 nt0.03□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YIL029CYIL029C 429 nt0.03□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.03□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 YPL044CYPL044C 549 nt0.03□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 PRP5YBR237W 2550 nt0.03□□□□□ -2.4
YJL009WP47078 RCO1YMR075W 2055 nt0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 snR72snR72 98 nt0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 RPL26AYLR344W 384 nt0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.3 ms