Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 LCD1YDR499W 2244 nt0.87□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YDL158CYDL158C 309 nt0.87□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.87□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.87□□□□□ -2.27
DDI1P40087 ALY2YJL084C 3141 nt0.86□□□□□ -2.27
DDI1P40087 RRT1YBL048W 312 nt0.86□□□□□ -2.27
DDI1P40087 IFH1YLR223C 3258 nt0.86□□□□□ -2.27
DDI1P40087 NUP157YER105C 4176 nt0.86□□□□□ -2.27
DDI1P40087 RPS27AYKL156W 249 nt0.85□□□□□ -2.27
DDI1P40087 EFR3YMR212C 2349 nt0.85□□□□□ -2.27
DDI1P40087 ERP4YOR016C 624 nt0.85□□□□□ -2.27
DDI1P40087 PDE2YOR360C 1581 nt0.85□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YPR153WYPR153W 423 nt0.85□□□□□ -2.27
DDI1P40087 MMS4YBR098W 2076 nt0.85□□□□□ -2.27
DDI1P40087 NPC2YDL046W 522 nt0.84□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YHR130CYHR130C 336 nt0.84□□□□□ -2.27
DDI1P40087 AIM29YKR074W 468 nt0.84□□□□□ -2.27
DDI1P40087 HCH1YNL281W 462 nt0.84□□□□□ -2.27
DDI1P40087 CDC33YOL139C 642 nt0.84□□□□□ -2.27
DDI1P40087 YOR199WYOR199W 330 nt0.84□□□□□ -2.27
DDI1P40087 PAU24YBR301W 363 nt0.83□□□□□ -2.28
DDI1P40087 SLI15YBR156C 2097 nt0.83□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YDL206WYDL206W 2289 nt0.83□□□□□ -2.28
DDI1P40087 TIM13YGR181W 318 nt0.82□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YHR125WYHR125W 306 nt0.82□□□□□ -2.28
DDI1P40087 ZIP2YGL249W 2115 nt0.82□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.81□□□□□ -2.28
DDI1P40087 ZEO1YOL109W 342 nt0.81□□□□□ -2.28
DDI1P40087 RIM20YOR275C 1986 nt0.81□□□□□ -2.28
DDI1P40087 WIP1YDR374W-A 270 nt0.8□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YBL071CYBL071C 309 nt0.8□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YJR003CYJR003C 1560 nt0.79□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YDL073WYDL073W 2955 nt0.79□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YGR290WYGR290W 444 nt0.79□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YKL202WYKL202W 582 nt0.79□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YNL122CYNL122C 348 nt0.79□□□□□ -2.28
DDI1P40087 BI2Q0110 1272 nt0.78□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YOR029WYOR029W 336 nt0.78□□□□□ -2.28
DDI1P40087 YDL011CYDL011C 324 nt0.77□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YDL196WYDL196W 330 nt0.77□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.77□□□□□ -2.29
DDI1P40087 snR54snR54 86 nt0.77□□□□□ -2.29
DDI1P40087 WAR1YML076C 2835 nt0.77□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YGR042WYGR042W 816 nt0.76□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YJL135WYJL135W 318 nt0.76□□□□□ -2.29
DDI1P40087 FYV7YLR068W 456 nt0.76□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YLR287CYLR287C 1068 nt0.76□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.76□□□□□ -2.29
DDI1P40087 RPB10YOR210W 213 nt0.76□□□□□ -2.29
DDI1P40087 PRP16YKR086W 3216 nt0.75□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.75□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.74□□□□□ -2.29
DDI1P40087 RPS30BYOR182C 192 nt0.74□□□□□ -2.29
DDI1P40087 GPG1YGL121C 381 nt0.73□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.73□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YLR171WYLR171W 390 nt0.73□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.73□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YOL160WYOL160W 342 nt0.73□□□□□ -2.29
DDI1P40087 PAN2YGL094C 3348 nt0.72□□□□□ -2.29
DDI1P40087 DIE2YGR227W 1578 nt0.72□□□□□ -2.29
DDI1P40087 SWF1YDR126W 1011 nt0.72□□□□□ -2.29
DDI1P40087 PAM16YJL104W 450 nt0.72□□□□□ -2.29
DDI1P40087 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.72□□□□□ -2.29
DDI1P40087 RKR1YMR247C 4689 nt0.71□□□□□ -2.3
DDI1P40087 snR72snR72 98 nt0.71□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.71□□□□□ -2.3
DDI1P40087 ECL1YGR146C 636 nt0.71□□□□□ -2.3
DDI1P40087 snR189snR189 189 nt0.71□□□□□ -2.3
DDI1P40087 LOA1YPR139C 903 nt0.71□□□□□ -2.3
DDI1P40087 snR51snR51 107 nt0.71□□□□□ -2.3
DDI1P40087 SEC1YDR164C 2175 nt0.71□□□□□ -2.3
DDI1P40087 PKH2YOL100W 3246 nt0.7□□□□□ -2.3
DDI1P40087 PAC1YOR269W 1485 nt0.7□□□□□ -2.3
DDI1P40087 IES4YOR189W 351 nt0.7□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YPL261CYPL261C 309 nt0.7□□□□□ -2.3
DDI1P40087 GEA2YEL022W 4380 nt0.7□□□□□ -2.3
DDI1P40087 DBP6YNR038W 1890 nt0.69□□□□□ -2.3
DDI1P40087 ALG13YGL047W 609 nt0.69□□□□□ -2.3
DDI1P40087 INA22YIR024C 651 nt0.69□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YPL229WYPL229W 621 nt0.69□□□□□ -2.3
DDI1P40087 RAD34YDR314C 2079 nt0.68□□□□□ -2.3
DDI1P40087 CBS1YDL069C 690 nt0.68□□□□□ -2.3
DDI1P40087 NHP2YDL208W 471 nt0.68□□□□□ -2.3
DDI1P40087 ISD11YER048W-A 285 nt0.68□□□□□ -2.3
DDI1P40087 TOM22YNL131W 459 nt0.68□□□□□ -2.3
DDI1P40087 LTE1YAL024C 4308 nt0.68□□□□□ -2.3
DDI1P40087 SDH7YDR511W 402 nt0.67□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YDR521WYDR521W 336 nt0.67□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.67□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YHL041WYHL041W 450 nt0.67□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YHL042WYHL042W 453 nt0.67□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YLR101CYLR101C 396 nt0.67□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YMR160WYMR160W 2451 nt0.67□□□□□ -2.3
DDI1P40087 UBC7YMR022W 498 nt0.66□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.66□□□□□ -2.3
DDI1P40087 snR41snR41 95 nt0.66□□□□□ -2.3
DDI1P40087 OST1YJL002C 1431 nt0.65□□□□□ -2.3
DDI1P40087 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.65□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.31
DDI1P40087 YNL303WYNL303W 348 nt0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.1 ms