Protein–RNA interactions for Protein: P34247

UTP11, U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UTP11P34247 RFX1YLR176C 2436 nt0.08□□□□□ -2.4
UTP11P34247 GPG1YGL121C 381 nt0.08□□□□□ -2.4
UTP11P34247 STF2YGR008C 255 nt0.08□□□□□ -2.4
UTP11P34247 YLR252WYLR252W 306 nt0.08□□□□□ -2.4
UTP11P34247 PET111YMR257C 2403 nt0.08□□□□□ -2.4
UTP11P34247 YGR228WYGR228W 345 nt0.07□□□□□ -2.4
UTP11P34247 IQG1YPL242C 4488 nt0.07□□□□□ -2.4
UTP11P34247 ZIP2YGL249W 2115 nt0.06□□□□□ -2.4
UTP11P34247 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.06□□□□□ -2.4
UTP11P34247 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 YGR115CYGR115C 780 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 YJR079WYJR079W 330 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 SDS22YKL193C 1017 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 LOA1YPR139C 903 nt0.05□□□□□ -2.4
UTP11P34247 PKH2YOL100W 3246 nt0.04□□□□□ -2.4
UTP11P34247 AFR1YDR085C 1863 nt0.04□□□□□ -2.4
UTP11P34247 WIP1YDR374W-A 270 nt0.04□□□□□ -2.4
UTP11P34247 BSC3YLR465C 309 nt0.04□□□□□ -2.4
UTP11P34247 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.04□□□□□ -2.4
UTP11P34247 BIG1YHR101C 1008 nt0.03□□□□□ -2.4
UTP11P34247 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.03□□□□□ -2.4
UTP11P34247 RPL26AYLR344W 384 nt0.03□□□□□ -2.4
UTP11P34247 UBC7YMR022W 498 nt0.03□□□□□ -2.4
UTP11P34247 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.03□□□□□ -2.4
UTP11P34247 CSM4YPL200W 471 nt0.03□□□□□ -2.4
UTP11P34247 SLX9YGR081C 633 nt0.02□□□□□ -2.41
UTP11P34247 YHL042WYHL042W 453 nt0.02□□□□□ -2.41
UTP11P34247 COX12YLR038C 252 nt0.02□□□□□ -2.41
UTP11P34247 YMR254CYMR254C 309 nt0.02□□□□□ -2.41
UTP11P34247 YDR269CYDR269C 324 nt0.01□□□□□ -2.41
UTP11P34247 HUG1YML058W-A 207 nt0.01□□□□□ -2.41
UTP11P34247 VIK1YPL253C 1944 nt0.01□□□□□ -2.41
UTP11P34247 SPO13YHR014W 876 nt0□□□□□ -2.41
UTP11P34247 ILM1YJR118C 612 nt0□□□□□ -2.41
UTP11P34247 UBS1YBR165W 834 nt0□□□□□ -2.41
UTP11P34247 POP7YBR167C 423 nt0□□□□□ -2.41
UTP11P34247 FYV10YIL097W 1551 nt-0.01□□□□□ -2.41
UTP11P34247 VMA21YGR105W 234 nt-0.01□□□□□ -2.41
UTP11P34247 YPL044CYPL044C 549 nt-0.01□□□□□ -2.41
UTP11P34247 snR9snR9 187 nt-0.02□□□□□ -2.41
UTP11P34247 YJL135WYJL135W 318 nt-0.02□□□□□ -2.41
UTP11P34247 ESP1YGR098C 4893 nt-0.02□□□□□ -2.41
UTP11P34247 CUL3YGR003W 2235 nt-0.02□□□□□ -2.41
UTP11P34247 INP2YMR163C 2118 nt-0.02□□□□□ -2.41
UTP11P34247 MYO1YHR023W 5787 nt-0.02□□□□□ -2.41
UTP11P34247 YGL230CYGL230C 444 nt-0.03□□□□□ -2.41
UTP11P34247 PHS1YJL097W 654 nt-0.03□□□□□ -2.41
UTP11P34247 YOR248WYOR248W 303 nt-0.03□□□□□ -2.41
UTP11P34247 IRC16YPR038W 360 nt-0.03□□□□□ -2.41
UTP11P34247 MCM10YIL150C 1716 nt-0.04□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YPT6YLR262C 648 nt-0.04□□□□□ -2.42
UTP11P34247 snR13snR13 124 nt-0.04□□□□□ -2.42
UTP11P34247 RCN2YOR220W 798 nt-0.04□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YCL002CYCL002C 792 nt-0.04□□□□□ -2.42
UTP11P34247 EFR3YMR212C 2349 nt-0.04□□□□□ -2.42
UTP11P34247 PRP42YDR235W 1635 nt-0.05□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.05□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YOL014WYOL014W 375 nt-0.05□□□□□ -2.42
UTP11P34247 RPB10YOR210W 213 nt-0.05□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YPR039WYPR039W 336 nt-0.05□□□□□ -2.42
UTP11P34247 THO2YNL139C 4794 nt-0.05□□□□□ -2.42
UTP11P34247 SEC8YPR055W 3198 nt-0.06□□□□□ -2.42
UTP11P34247 SCEIQ0160 708 nt-0.06□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.06□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.06□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YNL050CYNL050C 813 nt-0.06□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YOR053WYOR053W 342 nt-0.06□□□□□ -2.42
UTP11P34247 MLP1YKR095W 5628 nt-0.07□□□□□ -2.42
UTP11P34247 MRPL32YCR003W 552 nt-0.07□□□□□ -2.42
UTP11P34247 OLI1Q0130 231 nt-0.07□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.07□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YBR064WYBR064W 429 nt-0.07□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.08□□□□□ -2.42
UTP11P34247 MND1YGL183C 660 nt-0.08□□□□□ -2.42
UTP11P34247 PRP5YBR237W 2550 nt-0.08□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YGL239CYGL239C 315 nt-0.09□□□□□ -2.42
UTP11P34247 YLR198CYLR198C 360 nt-0.09□□□□□ -2.42
UTP11P34247 ORC3YLL004W 1851 nt-0.1□□□□□ -2.42
UTP11P34247 COX5BYIL111W 456 nt-0.1□□□□□ -2.43
UTP11P34247 AFB1YLR040C 675 nt-0.1□□□□□ -2.43
UTP11P34247 snR190snR190 190 nt-0.1□□□□□ -2.43
UTP11P34247 snR72snR72 98 nt-0.11□□□□□ -2.43
UTP11P34247 SSS1YDR086C 243 nt-0.11□□□□□ -2.43
UTP11P34247 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.11□□□□□ -2.43
UTP11P34247 COG8YML071C 1824 nt-0.12□□□□□ -2.43
UTP11P34247 YDL187CYDL187C 330 nt-0.12□□□□□ -2.43
UTP11P34247 YER135CYER135C 393 nt-0.12□□□□□ -2.43
UTP11P34247 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.12□□□□□ -2.43
UTP11P34247 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.12□□□□□ -2.43
UTP11P34247 PRP21YJL203W 843 nt-0.12□□□□□ -2.43
UTP11P34247 YMR321CYMR321C 318 nt-0.12□□□□□ -2.43
UTP11P34247 YOL160WYOL160W 342 nt-0.12□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 117.3 ms