Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

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Length 1,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 LSO2YGR169C-A 279 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 AFB1YLR040C 675 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YNL150WYNL150W 408 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 CUL3YGR003W 2235 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.29□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 RPS27AYKL156W 249 nt-0.3□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 GSP1YLR293C 660 nt-0.3□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YPR099CYPR099C 357 nt-0.3□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.3□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YHL042WYHL042W 453 nt-0.31□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YCL002CYCL002C 792 nt-0.31□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-0.32□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.32□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 BI4Q0120 1917 nt-0.32□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 snR79snR79 84 nt-0.32□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YDR029WYDR029W 315 nt-0.32□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 BSC3YLR465C 309 nt-0.33□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YNL050CYNL050C 813 nt-0.33□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 NPC2YDL046W 522 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YDL187CYDL187C 330 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 MMS21YEL019C 804 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 DFG10YIL049W 762 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YNL211CYNL211C 261 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 CDC33YOL139C 642 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YPL044CYPL044C 549 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 CSM4YPL200W 471 nt-0.34□□□□□ -2.46
YRF1-8P0CX22 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.35□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 snR8snR8 190 nt-0.36□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 YLR101CYLR101C 396 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 SOV1YMR066W 2697 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 IRC2YDR112W 309 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 TDA2YER071C 381 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 YBR071WYBR071W 636 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 YBR206WYBR206W 324 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 EFR3YMR212C 2349 nt-0.38□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 YDR008CYDR008C 351 nt-0.38□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 DAD1YDR016C 285 nt-0.38□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 BLS1YLR408C 369 nt-0.38□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 RMD6YEL072W 696 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 RPS7BYNL096C 573 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 YPL225WYPL225W 441 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 COX5BYIL111W 456 nt-0.4□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 ORC3YLL004W 1851 nt-0.4□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 snR59snR59 78 nt-0.4□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 GPX1YKL026C 504 nt-0.4□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 HTB2YBL002W 396 nt-0.4□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 YBR064WYBR064W 429 nt-0.4□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.41□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 YLR271WYLR271W 825 nt-0.41□□□□□ -2.47
YRF1-8P0CX22 PAN3YKL025C 2040 nt-0.42□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YDR344CYDR344C 444 nt-0.42□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 MAM33YIL070C 801 nt-0.42□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YJR079WYJR079W 330 nt-0.42□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YPL197CYPL197C 414 nt-0.42□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 PSF2YJL072C 642 nt-0.43□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.43□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 RUB1YDR139C 234 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 LIN1YHR156C 1023 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 OLI1Q0130 231 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YJR011CYJR011C 786 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YOL106WYOL106W 354 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 TFB6YOR352W 1032 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 RAD61YDR014W 1944 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 GIM5YML094W 492 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 SPC24YMR117C 642 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YPL185WYPL185W 396 nt-0.45□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 ASE1YOR058C 2658 nt-0.46□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.46□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 SEC10YLR166C 2616 nt-0.46□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 RFX1YLR176C 2436 nt-0.46□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.47□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YEL073CYEL073C 324 nt-0.47□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.47□□□□□ -2.48
YRF1-8P0CX22 YDR210WYDR210W 228 nt-0.47□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 COX7YMR256C 183 nt-0.47□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 MRPL31YKL138C 396 nt-0.48□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 snR128snR128 126 nt-0.48□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.49□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 ECM9YKR004C 1134 nt-0.49□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-0.49□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 snR44snR44 211 nt-0.49□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 YOL160WYOL160W 342 nt-0.5□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.5□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 YKU70YMR284W 1809 nt-0.5□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 NIP1YMR309C 2439 nt-0.51□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 YFR057WYFR057W 456 nt-0.51□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 RPS26AYGL189C 360 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 HTB1YDR224C 396 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 YJL135WYJL135W 318 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.52□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 ATC1YDR184C 885 nt-0.53□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.53□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 RSM23YGL129C 1353 nt-0.53□□□□□ -2.49
YRF1-8P0CX22 OST4YDL232W 111 nt-0.54□□□□□ -2.5
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