Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCNE2O96020 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms