Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMCO3A2RU48 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms