Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

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Length 764 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 RTR1YER139C 681 nt1.76□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YHR210CYHR210C 1026 nt1.76□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 MSH6YDR097C 3729 nt1.76□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YJR003CYJR003C 1560 nt1.76□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 TBS1YBR150C 3285 nt1.76□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 MYO2YOR326W 4725 nt1.75□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YGR035CYGR035C 351 nt1.75□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YIL059CYIL059C 366 nt1.75□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.75□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 MAK10YEL053C 2202 nt1.75□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 SWI6YLR182W 2412 nt1.75□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 LYS14YDR034C 2373 nt1.74□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 HSL1YKL101W 4557 nt1.74□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.74□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.74□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.74□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.74□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 MDM20YOL076W 2391 nt1.74□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 EFR3YMR212C 2349 nt1.73□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 IRC23YOR044W 474 nt1.73□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YOP1YPR028W 543 nt1.73□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 BPH1YCR032W 6504 nt1.72□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YEL057CYEL057C 702 nt1.72□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.72□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 DCP2YNL118C 2913 nt1.72□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 HMI1YOL095C 2121 nt1.72□□□□□ -2.13
AVL9Q12500 MEC1YBR136W 7107 nt1.71□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 CYC7YEL039C 342 nt1.71□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 YHL041WYHL041W 450 nt1.71□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 RFX1YLR176C 2436 nt1.71□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 FRK1YPL141C 2598 nt1.71□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 ZIP1YDR285W 2628 nt1.7□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 TRX1YLR043C 312 nt1.7□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 PAC1YOR269W 1485 nt1.69□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 VPS15YBR097W 4365 nt1.69□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 YAR053WYAR053W 297 nt1.69□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.69□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 NUT2YPR168W 474 nt1.69□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 YOR019WYOR019W 2193 nt1.69□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 MON2YNL297C 4911 nt1.69□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 RPL31AYDL075W 342 nt1.68□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 UPS1YLR193C 528 nt1.68□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.68□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 TRM3YDL112W 4311 nt1.67□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 SRP14YDL092W 441 nt1.67□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 YPR197CYPR197C 564 nt1.67□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 IRA1YBR140C 9279 nt1.67□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 MLH3YPL164C 2148 nt1.67□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 YHL037CYHL037C 402 nt1.66□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.66□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 YLL032CYLL032C 2478 nt1.66□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 SLY1YDR189W 2001 nt1.66□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 MUK1YPL070W 1839 nt1.66□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 SKI3YPR189W 4299 nt1.66□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 YLR419WYLR419W 4308 nt1.65□□□□□ -2.14
AVL9Q12500 SFB2YNL049C 2631 nt1.65□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.65□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 COA6YMR244C-A 315 nt1.65□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 BIL1YOR304C-A 231 nt1.65□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.65□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 SPO24YPR036W-A 204 nt1.65□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 DNF3YMR162C 4971 nt1.65□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 MRPL31YKL138C 396 nt1.64□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 SGO1YOR073W 1773 nt1.64□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 DGR2YKL121W 2559 nt1.63□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 YNL058CYNL058C 951 nt1.63□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 snR51snR51 107 nt1.63□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 ENV11YGR071C 2583 nt1.63□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 MVP1YMR004W 1536 nt1.62□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 RPS20YHL015W 366 nt1.62□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 CHS1YNL192W 3396 nt1.62□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 PIG1YLR273C 1947 nt1.62□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 KCS1YDR017C 3153 nt1.61□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 CAT8YMR280C 4302 nt1.61□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 PAU2YEL049W 363 nt1.61□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 RPL38YLR325C 237 nt1.61□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 SBE22YHR103W 2559 nt1.61□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 YLR422WYLR422W 5799 nt1.61□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 KIP1YBL063W 3336 nt1.6□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 CSN9YDR179C 489 nt1.6□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 RPB10YOR210W 213 nt1.6□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 SAS3YBL052C 2496 nt1.59□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 FIG2YCR089W 4830 nt1.59□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 EMC5YIL027C 426 nt1.59□□□□□ -2.15
AVL9Q12500 RKM1YPL208W 1752 nt1.59□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 CTF4YPR135W 2784 nt1.59□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 APL2YKL135C 2181 nt1.58□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.58□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.58□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 RIM20YOR275C 1986 nt1.58□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YBP1YBR216C 2025 nt1.57□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 snR72snR72 98 nt1.57□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.57□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YJL022WYJL022W 309 nt1.57□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YLR255CYLR255C 354 nt1.57□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 INP2YMR163C 2118 nt1.57□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.56□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 Q0142Q0142 177 nt1.56□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 RPL40BYKR094C 387 nt1.56□□□□□ -2.16
AVL9Q12500 COF1YLL050C 432 nt1.56□□□□□ -2.16
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