Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.81□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.81□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 ABM1YJR108W 372 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 YNL058CYNL058C 951 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 DNF3YMR162C 4971 nt1.8□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 LYS14YDR034C 2373 nt1.79□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 AGC1YPR021C 2709 nt1.79□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 YJR039WYJR039W 3366 nt1.79□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 RFX1YLR176C 2436 nt1.78□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 YHL041WYHL041W 450 nt1.78□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.78□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.78□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 YOP1YPR028W 543 nt1.78□□□□□ -2.12
SPE4Q12455 UBR2YLR024C 5619 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 LHS1YKL073W 2646 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 MUK1YPL070W 1839 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 MDM20YOL076W 2391 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 ATG11YPR049C 3537 nt1.77□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 YMR045CYMR045C 5268 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 MLH3YPL164C 2148 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 PAC1YOR269W 1485 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 PEP1YBL017C 4740 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 YOR093CYOR093C 4947 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 CYC7YEL039C 342 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 RPS20YHL015W 366 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 HIR3YJR140C 4947 nt1.76□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.75□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 NUT2YPR168W 474 nt1.75□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 MSH5YDL154W 2706 nt1.75□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 UTP21YLR409C 2820 nt1.74□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 SAS3YBL052C 2496 nt1.74□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 RPB10YOR210W 213 nt1.74□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 TDA9YML081W 3756 nt1.74□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 SGO1YOR073W 1773 nt1.74□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 UPS1YLR193C 528 nt1.73□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 SAR1YPL218W 573 nt1.73□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 RIM20YOR275C 1986 nt1.72□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 DGR2YKL121W 2559 nt1.72□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 SFB2YNL049C 2631 nt1.72□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 LRE1YCL051W 1752 nt1.72□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 CFT1YDR301W 4074 nt1.71□□□□□ -2.13
SPE4Q12455 HSL1YKL101W 4557 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 YLL032CYLL032C 2478 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 MRPL31YKL138C 396 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 TRX1YLR043C 312 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 snR51snR51 107 nt1.71□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 RKM1YPL208W 1752 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.7□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 IRC20YLR247C 4671 nt1.69□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 SRP14YDL092W 441 nt1.69□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 YHL037CYHL037C 402 nt1.69□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 RPL38YLR325C 237 nt1.69□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 YBP1YBR216C 2025 nt1.68□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 PCC1YKR095W-A 267 nt1.68□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 YLR255CYLR255C 354 nt1.68□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 YCL023CYCL023C 348 nt1.68□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 CTF4YPR135W 2784 nt1.68□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 YKL136WYKL136W 399 nt1.67□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.67□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 INP2YMR163C 2118 nt1.67□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 YNL144CYNL144C 2223 nt1.67□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 SEC5YDR166C 2916 nt1.67□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 SKI3YPR189W 4299 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 PKH3YDR466W 2697 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 SDH2YLL041C 801 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 TIM18YOR297C 579 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE4Q12455 YDR426CYDR426C 378 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 RPL40BYKR094C 387 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YAF9YNL107W 681 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 PIG1YLR273C 1947 nt1.64□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 PAU2YEL049W 363 nt1.64□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.64□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.64□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 ZIP2YGL249W 2115 nt1.63□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 CSN9YDR179C 489 nt1.63□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YHR210CYHR210C 1026 nt1.63□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 HTB2YBL002W 396 nt1.63□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 MEC1YBR136W 7107 nt1.62□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 RPL35AYDL191W 363 nt1.62□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 EMC5YIL027C 426 nt1.62□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.62□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 APL2YKL135C 2181 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YOR019WYOR019W 2193 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 RPL31AYDL075W 342 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YKL118WYKL118W 312 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YOR199WYOR199W 330 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YLR422WYLR422W 5799 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 NOC3YLR002C 1992 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 IRA1YBR140C 9279 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 snR72snR72 98 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 NPC2YDL046W 522 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YDR102CYDR102C 333 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YJR011CYJR011C 786 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 KIP1YBL063W 3336 nt1.6□□□□□ -2.15
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