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Protein–RNA interactions for Protein: Q12455
SPE4, Spermine synthase, yeast
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300 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SPE4
Q12455
YMR272W-B
YMR272W-B
108 nt
1.81
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
YPL038W-A
YPL038W-A
192 nt
1.81
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
ABM1
YJR108W
372 nt
1.8
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
YNL058C
YNL058C
951 nt
1.8
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
DNF3
YMR162C
4971 nt
1.8
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
LYS14
YDR034C
2373 nt
1.79
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
AGC1
YPR021C
2709 nt
1.79
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
YJR039W
YJR039W
3366 nt
1.79
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
RFX1
YLR176C
2436 nt
1.78
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
YHL041W
YHL041W
450 nt
1.78
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
YOR072W-A
YOR072W-A
249 nt
1.78
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
YPR016W-A
YPR016W-A
261 nt
1.78
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
YOP1
YPR028W
543 nt
1.78
□□□□□ -2.12
SPE4
Q12455
UBR2
YLR024C
5619 nt
1.77
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
LHS1
YKL073W
2646 nt
1.77
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
MUK1
YPL070W
1839 nt
1.77
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
MDM20
YOL076W
2391 nt
1.77
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
ATG11
YPR049C
3537 nt
1.77
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
YMR045C
YMR045C
5268 nt
1.76
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
MLH3
YPL164C
2148 nt
1.76
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
PAC1
YOR269W
1485 nt
1.76
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
PEP1
YBL017C
4740 nt
1.76
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
YOR093C
YOR093C
4947 nt
1.76
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
YDR003W-A
YDR003W-A
123 nt
1.76
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
CYC7
YEL039C
342 nt
1.76
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
RPS20
YHL015W
366 nt
1.76
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
HIR3
YJR140C
4947 nt
1.76
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
YDL240C-A
YDL240C-A
138 nt
1.75
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
NUT2
YPR168W
474 nt
1.75
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
MSH5
YDL154W
2706 nt
1.75
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
UTP21
YLR409C
2820 nt
1.74
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
SAS3
YBL052C
2496 nt
1.74
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
RPB10
YOR210W
213 nt
1.74
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
TDA9
YML081W
3756 nt
1.74
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
SGO1
YOR073W
1773 nt
1.74
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
UPS1
YLR193C
528 nt
1.73
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
SAR1
YPL218W
573 nt
1.73
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
RIM20
YOR275C
1986 nt
1.72
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
DGR2
YKL121W
2559 nt
1.72
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
SFB2
YNL049C
2631 nt
1.72
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
LRE1
YCL051W
1752 nt
1.72
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
CFT1
YDR301W
4074 nt
1.71
□□□□□ -2.13
SPE4
Q12455
HSL1
YKL101W
4557 nt
1.71
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
YLL032C
YLL032C
2478 nt
1.71
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
tW(UCA)Q
tW(UCA)Q
74 nt
1.71
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
MRPL31
YKL138C
396 nt
1.71
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
TRX1
YLR043C
312 nt
1.71
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
snR51
snR51
107 nt
1.71
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
RKM1
YPL208W
1752 nt
1.7
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
YML007C-A
YML007C-A
111 nt
1.7
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
IRC20
YLR247C
4671 nt
1.69
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
SRP14
YDL092W
441 nt
1.69
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
YHL037C
YHL037C
402 nt
1.69
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
RPL38
YLR325C
237 nt
1.69
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
YBP1
YBR216C
2025 nt
1.68
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
PCC1
YKR095W-A
267 nt
1.68
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
YLR255C
YLR255C
354 nt
1.68
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
YCL023C
YCL023C
348 nt
1.68
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
CTF4
YPR135W
2784 nt
1.68
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
YKL136W
YKL136W
399 nt
1.67
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
YMR141W-A
YMR141W-A
225 nt
1.67
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
INP2
YMR163C
2118 nt
1.67
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
YNL144C
YNL144C
2223 nt
1.67
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
SEC5
YDR166C
2916 nt
1.67
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
SKI3
YPR189W
4299 nt
1.66
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
PKH3
YDR466W
2697 nt
1.66
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
SDH2
YLL041C
801 nt
1.66
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
TIM18
YOR297C
579 nt
1.66
□□□□□ -2.14
SPE4
Q12455
YDR426C
YDR426C
378 nt
1.65
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
RPL40B
YKR094C
387 nt
1.65
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YAF9
YNL107W
681 nt
1.65
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
PIG1
YLR273C
1947 nt
1.64
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
PAU2
YEL049W
363 nt
1.64
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YOR108C-A
YOR108C-A
210 nt
1.64
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YPR002C-A
YPR002C-A
198 nt
1.64
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
ZIP2
YGL249W
2115 nt
1.63
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
CSN9
YDR179C
489 nt
1.63
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YHR210C
YHR210C
1026 nt
1.63
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
HTB2
YBL002W
396 nt
1.63
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
MEC1
YBR136W
7107 nt
1.62
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
RPL35A
YDL191W
363 nt
1.62
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
EMC5
YIL027C
426 nt
1.62
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
AI5_ALPHA
Q0070
1893 nt
1.62
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
APL2
YKL135C
2181 nt
1.61
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YOR019W
YOR019W
2193 nt
1.61
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
RPL31A
YDL075W
342 nt
1.61
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YHR007C-A
YHR007C-A
216 nt
1.61
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YKL118W
YKL118W
312 nt
1.61
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YMR242W-A
YMR242W-A
90 nt
1.61
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YOR199W
YOR199W
330 nt
1.61
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YLR422W
YLR422W
5799 nt
1.61
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
NOC3
YLR002C
1992 nt
1.61
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
IRA1
YBR140C
9279 nt
1.61
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
snR72
snR72
98 nt
1.6
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
NPC2
YDL046W
522 nt
1.6
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YDR102C
YDR102C
333 nt
1.6
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YDR169C-A
YDR169C-A
150 nt
1.6
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
tT(UGU)H
tT(UGU)H
72 nt
1.6
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
YJR011C
YJR011C
786 nt
1.6
□□□□□ -2.15
SPE4
Q12455
KIP1
YBL063W
3336 nt
1.6
□□□□□ -2.15
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