Protein–RNA interactions for Protein: Q12365

BBP1, Spindle pole component BBP1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BBP1Q12365 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YGL217CYGL217C 342 nt0.99□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 HIT1YJR055W 495 nt0.99□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YML003WYML003W 873 nt0.99□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 CLU1YMR012W 3834 nt0.99□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 DOP1YDR141C 5097 nt0.99□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 ZIP1YDR285W 2628 nt0.99□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 SPT7YBR081C 3999 nt0.98□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 MKT1YNL085W 2493 nt0.98□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 VPS54YDR027C 2670 nt0.98□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YDL211CYDL211C 1119 nt0.98□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.98□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.98□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YGL239CYGL239C 315 nt0.98□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.98□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 RPL16AYIL133C 600 nt0.98□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 SLX4YLR135W 2247 nt0.98□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 RAD50YNL250W 3939 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 LYS14YDR034C 2373 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 GDS1YOR355W 1569 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 NUP188YML103C 4968 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 MUK1YPL070W 1839 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 PXA2YKL188C 2562 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YDR114CYDR114C 303 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 RPF1YHR088W 888 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YHR130CYHR130C 336 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 NFU1YKL040C 771 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 YML108WYML108W 318 nt0.97□□□□□ -2.25
BBP1Q12365 SEC5YDR166C 2916 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 SIP4YJL089W 2490 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 SWI4YER111C 3282 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 PIG1YLR273C 1947 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 SRP14YDL092W 441 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 URM1YIL008W 300 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YLR269CYLR269C 351 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 RPL32YBL092W 393 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YPR063CYPR063C 423 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 ROM2YLR371W 4071 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 ENV11YGR071C 2583 nt0.96□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YGR045CYGR045C 363 nt0.95□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.95□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 RPL9BYNL067W 576 nt0.95□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 RTR1YER139C 681 nt0.94□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YPL182CYPL182C 384 nt0.94□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 RUF22RUF22 515 nt0.93□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YNL122CYNL122C 348 nt0.93□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 NOC3YLR002C 1992 nt0.93□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YLL054CYLL054C 2532 nt0.93□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 SEC3YER008C 4011 nt0.92□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.92□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.92□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YGR290WYGR290W 444 nt0.92□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 NBL1YHR199C-A 222 nt0.92□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 AIM29YKR074W 468 nt0.92□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.92□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 PIP2YOR363C 2991 nt0.92□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 SWI6YLR182W 2412 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 APL3YBL037W 3078 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 BI2Q0110 1272 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YHR125WYHR125W 306 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 PHS1YJL097W 654 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YLL020CYLL020C 306 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YNL303WYNL303W 348 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 snR14snR14 160 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 RFX1YLR176C 2436 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 SPT21YMR179W 2277 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YLL032CYLL032C 2478 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 TTI1YKL033W 3117 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 SMC1YFL008W 3678 nt0.91□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 APL2YKL135C 2181 nt0.9□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 EAF1YDR359C 2949 nt0.9□□□□□ -2.26
BBP1Q12365 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.9□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 NUT2YPR168W 474 nt0.9□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 snR54snR54 86 nt0.9□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 STB6YKL072W 2301 nt0.89□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 ALY2YJL084C 3141 nt0.89□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 NUP145YGL092W 3954 nt0.89□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.89□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 RTT102YGR275W 474 nt0.89□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 ZEO1YOL109W 342 nt0.89□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 CDC39YCR093W 6327 nt0.88□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 YDR269CYDR269C 324 nt0.88□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 YIL059CYIL059C 366 nt0.88□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 MRPL31YKL138C 396 nt0.88□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 FYV7YLR068W 456 nt0.88□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 YLR171WYLR171W 390 nt0.87□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 CDC33YOL139C 642 nt0.87□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 ERP4YOR016C 624 nt0.87□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 YBR012CYBR012C 420 nt0.87□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 MPT5YGL178W 2580 nt0.87□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 IFH1YLR223C 3258 nt0.86□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.86□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 UPS1YLR193C 528 nt0.86□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 HCH1YNL281W 462 nt0.86□□□□□ -2.27
BBP1Q12365 SCW11YGL028C 1629 nt0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.6 ms