Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.58□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 YOR121CYOR121C 306 nt1.58□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.58□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 EFR3YMR212C 2349 nt1.58□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 MON2YNL297C 4911 nt1.57□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.57□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 YPR012WYPR012W 255 nt1.57□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 YCL023CYCL023C 348 nt1.57□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 SFB2YNL049C 2631 nt1.57□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 RFX1YLR176C 2436 nt1.57□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 MLH3YPL164C 2148 nt1.57□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 IRA1YBR140C 9279 nt1.56□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 HIT1YJR055W 495 nt1.56□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 SRP14YDL092W 441 nt1.54□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 CYC7YEL039C 342 nt1.54□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.54□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 CTF4YPR135W 2784 nt1.54□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 KCS1YDR017C 3153 nt1.54□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 SLY1YDR189W 2001 nt1.54□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 DGR2YKL121W 2559 nt1.53□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 MEC1YBR136W 7107 nt1.53□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 HSL1YKL101W 4557 nt1.53□□□□□ -2.16
VAM3Q12241 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.52□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 NUT2YPR168W 474 nt1.52□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YLL032CYLL032C 2478 nt1.52□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YOR019WYOR019W 2193 nt1.52□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YHL041WYHL041W 450 nt1.51□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 EMC5YIL027C 426 nt1.51□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 MRPL31YKL138C 396 nt1.51□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YLR334CYLR334C 381 nt1.51□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 SPO24YPR036W-A 204 nt1.51□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 MUK1YPL070W 1839 nt1.5□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 ATG31YDR022C 591 nt1.5□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 PAU2YEL049W 363 nt1.5□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YHL037CYHL037C 402 nt1.5□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 PIK1YNL267W 3201 nt1.5□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 ADR1YDR216W 3972 nt1.5□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YJR003CYJR003C 1560 nt1.5□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 PIG1YLR273C 1947 nt1.49□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YJL022WYJL022W 309 nt1.49□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 IRC23YOR044W 474 nt1.49□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 RKM1YPL208W 1752 nt1.49□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 ENV11YGR071C 2583 nt1.48□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 COF1YLL050C 432 nt1.48□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 UPS1YLR193C 528 nt1.48□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.48□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.48□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YLR422WYLR422W 5799 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 SAS3YBL052C 2496 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 BST1YFL025C 3090 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 SXM1YDR395W 2835 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 SSK2YNR031C 4740 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 SBE22YHR103W 2559 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 HMRA1YCR097W 381 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YNL058CYNL058C 951 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 PAC1YOR269W 1485 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 ALK1YGL021W 2283 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 YLR419WYLR419W 4308 nt1.47□□□□□ -2.17
VAM3Q12241 KAP122YGL016W 3246 nt1.46□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 CHS1YNL192W 3396 nt1.46□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 NCA2YPR155C 1851 nt1.46□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YGR035CYGR035C 351 nt1.46□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.46□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 RPL40BYKR094C 387 nt1.46□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.46□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 snR51snR51 107 nt1.46□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 UFD2YDL190C 2886 nt1.46□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 SAC3YDR159W 3906 nt1.46□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 APL2YKL135C 2181 nt1.45□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YLR140WYLR140W 327 nt1.45□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YAR053WYAR053W 297 nt1.45□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YOR029WYOR029W 336 nt1.45□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 RPB10YOR210W 213 nt1.45□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 BRR2YER172C 6492 nt1.45□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 MVP1YMR004W 1536 nt1.45□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 SEC5YDR166C 2916 nt1.44□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.44□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.44□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.44□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 VPS55YJR044C 423 nt1.44□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YPL261CYPL261C 309 nt1.44□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 RAD50YNL250W 3939 nt1.44□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 SMC4YLR086W 4257 nt1.43□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YOR376WYOR376W 369 nt1.43□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 SGO1YOR073W 1773 nt1.43□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.43□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 CFT1YDR301W 4074 nt1.42□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 NOC3YLR002C 1992 nt1.42□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 SDH2YLL041C 801 nt1.42□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YBR012CYBR012C 420 nt1.42□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 TIM18YOR297C 579 nt1.42□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 NUT1YGL151W 3399 nt1.42□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.41□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 snR56snR56 88 nt1.41□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YGL217CYGL217C 342 nt1.41□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 RPL38YLR325C 237 nt1.41□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 INP2YMR163C 2118 nt1.41□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.41□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.41□□□□□ -2.18
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