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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
YGR174W-A
YGR174W-A
87 nt
1.58
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
YOR121C
YOR121C
306 nt
1.58
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
YPR170W-A
YPR170W-A
186 nt
1.58
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
EFR3
YMR212C
2349 nt
1.58
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
MON2
YNL297C
4911 nt
1.57
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
YER137W-A
YER137W-A
306 nt
1.57
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
YPR012W
YPR012W
255 nt
1.57
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
YCL023C
YCL023C
348 nt
1.57
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
SFB2
YNL049C
2631 nt
1.57
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
RFX1
YLR176C
2436 nt
1.57
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
MLH3
YPL164C
2148 nt
1.57
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
IRA1
YBR140C
9279 nt
1.56
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
HIT1
YJR055W
495 nt
1.56
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
SRP14
YDL092W
441 nt
1.54
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
CYC7
YEL039C
342 nt
1.54
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
YMR272W-B
YMR272W-B
108 nt
1.54
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
CTF4
YPR135W
2784 nt
1.54
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
KCS1
YDR017C
3153 nt
1.54
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
SLY1
YDR189W
2001 nt
1.54
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
DGR2
YKL121W
2559 nt
1.53
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
MEC1
YBR136W
7107 nt
1.53
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
HSL1
YKL101W
4557 nt
1.53
□□□□□ -2.16
VAM3
Q12241
YMR230W-A
YMR230W-A
189 nt
1.52
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
NUT2
YPR168W
474 nt
1.52
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YLL032C
YLL032C
2478 nt
1.52
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YOR019W
YOR019W
2193 nt
1.52
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YHL041W
YHL041W
450 nt
1.51
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
EMC5
YIL027C
426 nt
1.51
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
MRPL31
YKL138C
396 nt
1.51
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YLR334C
YLR334C
381 nt
1.51
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
SPO24
YPR036W-A
204 nt
1.51
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
MUK1
YPL070W
1839 nt
1.5
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
ATG31
YDR022C
591 nt
1.5
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
PAU2
YEL049W
363 nt
1.5
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YHL037C
YHL037C
402 nt
1.5
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
PIK1
YNL267W
3201 nt
1.5
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
ADR1
YDR216W
3972 nt
1.5
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YJR003C
YJR003C
1560 nt
1.5
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
PIG1
YLR273C
1947 nt
1.49
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YJL022W
YJL022W
309 nt
1.49
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
IRC23
YOR044W
474 nt
1.49
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
RKM1
YPL208W
1752 nt
1.49
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
ENV11
YGR071C
2583 nt
1.48
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
COF1
YLL050C
432 nt
1.48
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
UPS1
YLR193C
528 nt
1.48
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YMR141W-A
YMR141W-A
225 nt
1.48
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YOL159C-A
YOL159C-A
273 nt
1.48
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YLR422W
YLR422W
5799 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
SAS3
YBL052C
2496 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
BST1
YFL025C
3090 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
SXM1
YDR395W
2835 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
SSK2
YNR031C
4740 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
SBE22
YHR103W
2559 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
HMRA1
YCR097W
381 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YAL063C-A
YAL063C-A
291 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YNL058C
YNL058C
951 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
PAC1
YOR269W
1485 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
ALK1
YGL021W
2283 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
YLR419W
YLR419W
4308 nt
1.47
□□□□□ -2.17
VAM3
Q12241
KAP122
YGL016W
3246 nt
1.46
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
CHS1
YNL192W
3396 nt
1.46
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
NCA2
YPR155C
1851 nt
1.46
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YGR035C
YGR035C
351 nt
1.46
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YHL046W-A
YHL046W-A
327 nt
1.46
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
RPL40B
YKR094C
387 nt
1.46
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YOR072W-A
YOR072W-A
249 nt
1.46
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
snR51
snR51
107 nt
1.46
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
UFD2
YDL190C
2886 nt
1.46
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
SAC3
YDR159W
3906 nt
1.46
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
APL2
YKL135C
2181 nt
1.45
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YLR140W
YLR140W
327 nt
1.45
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YAR053W
YAR053W
297 nt
1.45
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YOR029W
YOR029W
336 nt
1.45
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
RPB10
YOR210W
213 nt
1.45
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
BRR2
YER172C
6492 nt
1.45
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
MVP1
YMR004W
1536 nt
1.45
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
SEC5
YDR166C
2916 nt
1.44
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YDR182W-A
YDR182W-A
204 nt
1.44
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YHR052W-A
YHR052W-A
195 nt
1.44
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YHR054W-A
YHR054W-A
195 nt
1.44
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
VPS55
YJR044C
423 nt
1.44
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YPL261C
YPL261C
309 nt
1.44
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
RAD50
YNL250W
3939 nt
1.44
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
SMC4
YLR086W
4257 nt
1.43
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YOR376W
YOR376W
369 nt
1.43
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
SGO1
YOR073W
1773 nt
1.43
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
AI5_ALPHA
Q0070
1893 nt
1.43
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
CFT1
YDR301W
4074 nt
1.42
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
NOC3
YLR002C
1992 nt
1.42
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
SDH2
YLL041C
801 nt
1.42
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YBR012C
YBR012C
420 nt
1.42
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
TIM18
YOR297C
579 nt
1.42
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
NUT1
YGL151W
3399 nt
1.42
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YGR109W-B
YGR109W-B
4644 nt
1.41
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
snR56
snR56
88 nt
1.41
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YGL217C
YGL217C
342 nt
1.41
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
RPL38
YLR325C
237 nt
1.41
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
INP2
YMR163C
2118 nt
1.41
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YMR175W-A
YMR175W-A
195 nt
1.41
□□□□□ -2.18
VAM3
Q12241
YMR242W-A
YMR242W-A
90 nt
1.41
□□□□□ -2.18
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