Protein–RNA interactions for Protein: Q12089

AEP3, ATPase expression protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AEP3Q12089 RPL9BYNL067W 576 nt1.48□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 FYV12YOR183W 390 nt1.48□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 ATG11YPR049C 3537 nt1.48□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 POL5YEL055C 3069 nt1.48□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 DGR2YKL121W 2559 nt1.48□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 MEC1YBR136W 7107 nt1.47□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 RFX1YLR176C 2436 nt1.47□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 SXM1YDR395W 2835 nt1.47□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 SRP14YDL092W 441 nt1.47□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 YDR269CYDR269C 324 nt1.47□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 PAU2YEL049W 363 nt1.47□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 YIL059CYIL059C 366 nt1.47□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 YOL159CYOL159C 516 nt1.47□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 YBP1YBR216C 2025 nt1.47□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 SSK2YNR031C 4740 nt1.47□□□□□ -2.17
AEP3Q12089 YAP6YDR259C 1152 nt1.46□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YAR047CYAR047C 321 nt1.46□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 PIG1YLR273C 1947 nt1.46□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 ENV11YGR071C 2583 nt1.46□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 DNF3YMR162C 4971 nt1.45□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 HCH1YNL281W 462 nt1.45□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YPL229WYPL229W 621 nt1.45□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 EFR3YMR212C 2349 nt1.45□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 FYV8YGR196C 2454 nt1.45□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 PET127YOR017W 2403 nt1.45□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 UFD2YDL190C 2886 nt1.45□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YLL032CYLL032C 2478 nt1.44□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YHR138CYHR138C 345 nt1.44□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YKL202WYKL202W 582 nt1.44□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 RPL26AYLR344W 384 nt1.44□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.44□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 MVP1YMR004W 1536 nt1.44□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 SWF1YDR126W 1011 nt1.43□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 CYC7YEL039C 342 nt1.43□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YHL037CYHL037C 402 nt1.43□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YLR140WYLR140W 327 nt1.43□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 ISF1YMR081C 1017 nt1.43□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YOR376WYOR376W 369 nt1.43□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 LEE1YPL054W 906 nt1.43□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 PIK1YNL267W 3201 nt1.43□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 CFT1YDR301W 4074 nt1.43□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YCS4YLR272C 3531 nt1.43□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YKL083WYKL083W 615 nt1.42□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.42□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YBR285WYBR285W 435 nt1.42□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 SMC4YLR086W 4257 nt1.42□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 TRM732YMR259C 4263 nt1.42□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 NUT1YGL151W 3399 nt1.42□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 PCF11YDR228C 1881 nt1.41□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YGL217CYGL217C 342 nt1.41□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 MRPL31YKL138C 396 nt1.41□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.41□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 RAD50YNL250W 3939 nt1.41□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 EST2YLR318W 2655 nt1.41□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 HKR1YDR420W 5409 nt1.41□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 SLY1YDR189W 2001 nt1.4□□□□□ -2.18
AEP3Q12089 APL2YKL135C 2181 nt1.4□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 CCH1YGR217W 6120 nt1.4□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 BSC3YLR465C 309 nt1.4□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 YOR053WYOR053W 342 nt1.4□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 TIM18YOR297C 579 nt1.4□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 NUT2YPR168W 474 nt1.4□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 PMD1YER132C 5262 nt1.4□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.39□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.39□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 FIG2YCR089W 4830 nt1.39□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 SEC5YDR166C 2916 nt1.39□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 SGO1YOR073W 1773 nt1.38□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 MUK1YPL070W 1839 nt1.38□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 SAS3YBL052C 2496 nt1.38□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 YJL015CYJL015C 285 nt1.37□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 UPS1YLR193C 528 nt1.37□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.37□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 YSY6YBR162W-A 198 nt1.37□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 SLX4YLR135W 2247 nt1.37□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 NOC3YLR002C 1992 nt1.37□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 SEC21YNL287W 2808 nt1.37□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 MSN5YDR335W 3675 nt1.36□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.36□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 VPS54YDR027C 2670 nt1.36□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.35□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 YHL041WYHL041W 450 nt1.35□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 RRT1YBL048W 312 nt1.35□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.35□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 KIP1YBL063W 3336 nt1.35□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 YFL019CYFL019C 354 nt1.34□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.34□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 COA6YMR244C-A 315 nt1.34□□□□□ -2.19
AEP3Q12089 AZF1YOR113W 2745 nt1.33□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 YLL054CYLL054C 2532 nt1.33□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.32□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.32□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 SDH2YLL041C 801 nt1.32□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.32□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.32□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 snR14snR14 160 nt1.32□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 PBY1YBR094W 2262 nt1.31□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 YDL211CYDL211C 1119 nt1.31□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 YDR157WYDR157W 402 nt1.31□□□□□ -2.2
AEP3Q12089 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.3 ms