Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 YDL206WYDL206W 2289 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YDR008CYDR008C 351 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 BMT5YIL096C 1011 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 PAM16YJL104W 450 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 STO1YMR125W 2586 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 SCW11YGL028C 1629 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 FIG4YNL325C 2640 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YAR009CYAR009C 3591 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 SPO23YBR250W 1572 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 snR84snR84 550 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YDR114CYDR114C 303 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YJR079WYJR079W 330 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YBR032WYBR032W 303 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YBR071WYBR071W 636 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 SWI6YLR182W 2412 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 LYS14YDR034C 2373 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 MXR1YER042W 555 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 SCEIQ0160 708 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 SPO13YHR014W 876 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 TMA22YJR014W 597 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 HIT1YJR055W 495 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 ECM9YKR004C 1134 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YOR199WYOR199W 330 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG41Q12048 YDL196WYDL196W 330 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 SDH2YLL041C 801 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 SLM6YBR266C 453 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 UBP3YER151C 2739 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 SLD3YGL113W 2007 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 NBL1YHR199C-A 222 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 IPP1YBR011C 864 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 PDE2YOR360C 1581 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 PPN1YDR452W 2025 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 AFR1YDR085C 1863 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 PXA2YKL188C 2562 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YDL187CYDL187C 330 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 SWF1YDR126W 1011 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 GMC2YLR445W 567 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 RKR1YMR247C 4689 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YDL073WYDL073W 2955 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YJR087WYJR087W 351 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YLR252WYLR252W 306 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YOR248WYOR248W 303 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 MMS4YBR098W 2076 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 SLY1YDR189W 2001 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 LCD1YDR499W 2244 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 OCA6YDR067C 675 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 SLX9YGR081C 633 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 AFB1YLR040C 675 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 UPS1YLR193C 528 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 ALY2YJL084C 3141 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 ENV11YGR071C 2583 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG41Q12048 APL2YKL135C 2181 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YLR198CYLR198C 360 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 IES4YOR189W 351 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YML002WYML002W 2214 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YLL032CYLL032C 2478 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 UTP10YJL109C 5310 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 ALG13YGL047W 609 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 RRT1YBL048W 312 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YOL029CYOL029C 606 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 WAR1YML076C 2835 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YIL059CYIL059C 366 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 MRPL31YKL138C 396 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YPR153WYPR153W 423 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 SPO11YHL022C 1197 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 DCP1YOL149W 696 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 GRX5YPL059W 453 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YPR039WYPR039W 336 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 DBP6YNR038W 1890 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 RFX1YLR176C 2436 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 MET32YDR253C 576 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 SLI15YBR156C 2097 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YGR042WYGR042W 816 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 ECM12YHR021W-A 456 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YIL029CYIL029C 429 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 ILM1YJR118C 612 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 RPL38YLR325C 237 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 YNL050CYNL050C 813 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 RPL32YBL092W 393 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 IRC16YPR038W 360 nt0.41□□□□□ -2.34
ATG41Q12048 NPC2YDL046W 522 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG41Q12048 ISD11YER048W-A 285 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG41Q12048 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG41Q12048 INA22YIR024C 651 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG41Q12048 PRP21YJL203W 843 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG41Q12048 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG41Q12048 PRP16YKR086W 3216 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG41Q12048 GEA2YEL022W 4380 nt0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.6 ms