Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS1P54277 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS1P54277 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS1P54277 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS1P54277 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS1P54277 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS1P54277 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS1P54277 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS1P54277 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS1P54277 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS1P54277 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS1P54277 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PMS1P54277 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMS1P54277 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMS1P54277 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMS1P54277 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMS1P54277 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms