Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

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Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 ARP9YMR033W 1404 nt-0.91□□□□□ -2.56
SSK2P53599 NIP1YMR309C 2439 nt-0.92□□□□□ -2.56
SSK2P53599 TMA20YER007C-A 546 nt-0.93□□□□□ -2.56
SSK2P53599 ORC3YLL004W 1851 nt-0.94□□□□□ -2.56
SSK2P53599 HNT1YDL125C 477 nt-0.94□□□□□ -2.56
SSK2P53599 RPS10AYOR293W 318 nt-0.94□□□□□ -2.56
SSK2P53599 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt-0.94□□□□□ -2.56
SSK2P53599 NOC3YLR002C 1992 nt-0.95□□□□□ -2.56
SSK2P53599 snR35snR35 204 nt-0.96□□□□□ -2.56
SSK2P53599 FYV10YIL097W 1551 nt-0.96□□□□□ -2.56
SSK2P53599 YLR252WYLR252W 306 nt-0.97□□□□□ -2.56
SSK2P53599 CGI121YML036W 546 nt-0.97□□□□□ -2.56
SSK2P53599 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.98□□□□□ -2.57
SSK2P53599 YNL211CYNL211C 261 nt-0.98□□□□□ -2.57
SSK2P53599 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt-0.98□□□□□ -2.57
SSK2P53599 MMS2YGL087C 414 nt-1□□□□□ -2.57
SSK2P53599 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-1□□□□□ -2.57
SSK2P53599 YGR265WYGR265W 411 nt-1□□□□□ -2.57
SSK2P53599 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt-1□□□□□ -2.57
SSK2P53599 GSP1YLR293C 660 nt-1.01□□□□□ -2.57
SSK2P53599 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-1.02□□□□□ -2.57
SSK2P53599 HTB2YBL002W 396 nt-1.02□□□□□ -2.57
SSK2P53599 BET5YML077W 480 nt-1.02□□□□□ -2.57
SSK2P53599 RUF22RUF22 515 nt-1.02□□□□□ -2.57
SSK2P53599 YPL080CYPL080C 327 nt-1.02□□□□□ -2.57
SSK2P53599 LEE1YPL054W 906 nt-1.03□□□□□ -2.57
SSK2P53599 SPO23YBR250W 1572 nt-1.03□□□□□ -2.57
SSK2P53599 ERV14YGL054C 417 nt-1.04□□□□□ -2.58
SSK2P53599 NEJ1YLR265C 1029 nt-1.04□□□□□ -2.58
SSK2P53599 YBL094CYBL094C 333 nt-1.04□□□□□ -2.58
SSK2P53599 AME1YBR211C 975 nt-1.04□□□□□ -2.58
SSK2P53599 YDR029WYDR029W 315 nt-1.04□□□□□ -2.58
SSK2P53599 TAP42YMR028W 1101 nt-1.04□□□□□ -2.58
SSK2P53599 SPR2YOR214C 711 nt-1.04□□□□□ -2.58
SSK2P53599 YCL002CYCL002C 792 nt-1.05□□□□□ -2.58
SSK2P53599 MMS4YBR098W 2076 nt-1.05□□□□□ -2.58
SSK2P53599 PHO92YDR374C 921 nt-1.06□□□□□ -2.58
SSK2P53599 YOL024WYOL024W 519 nt-1.06□□□□□ -2.58
SSK2P53599 YPL205CYPL205C 345 nt-1.06□□□□□ -2.58
SSK2P53599 DIE2YGR227W 1578 nt-1.07□□□□□ -2.58
SSK2P53599 RPS16AYMR143W 432 nt-1.08□□□□□ -2.58
SSK2P53599 OLI1Q0130 231 nt-1.08□□□□□ -2.58
SSK2P53599 YLR458WYLR458W 381 nt-1.08□□□□□ -2.58
SSK2P53599 TFB6YOR352W 1032 nt-1.08□□□□□ -2.58
SSK2P53599 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt-1.09□□□□□ -2.58
SSK2P53599 YPR096CYPR096C 303 nt-1.09□□□□□ -2.58
SSK2P53599 YKU70YMR284W 1809 nt-1.1□□□□□ -2.59
SSK2P53599 snR68snR68 136 nt-1.1□□□□□ -2.59
SSK2P53599 RPS26AYGL189C 360 nt-1.1□□□□□ -2.59
SSK2P53599 ECM9YKR004C 1134 nt-1.1□□□□□ -2.59
SSK2P53599 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt-1.11□□□□□ -2.59
SSK2P53599 YOR015WYOR015W 360 nt-1.12□□□□□ -2.59
SSK2P53599 GEP7YGL057C 864 nt-1.13□□□□□ -2.59
SSK2P53599 YJL120WYJL120W 324 nt-1.13□□□□□ -2.59
SSK2P53599 BSC3YLR465C 309 nt-1.13□□□□□ -2.59
SSK2P53599 MAM33YIL070C 801 nt-1.15□□□□□ -2.59
SSK2P53599 CHZ1YER030W 462 nt-1.16□□□□□ -2.59
SSK2P53599 GPX2YBR244W 489 nt-1.16□□□□□ -2.59
SSK2P53599 NOT5YPR072W 1683 nt-1.16□□□□□ -2.59
SSK2P53599 AI3Q0060 1248 nt-1.17□□□□□ -2.6
SSK2P53599 HTB1YDR224C 396 nt-1.18□□□□□ -2.6
SSK2P53599 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt-1.18□□□□□ -2.6
SSK2P53599 RMD6YEL072W 696 nt-1.19□□□□□ -2.6
SSK2P53599 YLR402WYLR402W 192 nt-1.19□□□□□ -2.6
SSK2P53599 UPS1YLR193C 528 nt-1.2□□□□□ -2.6
SSK2P53599 MRPS8YMR158W 468 nt-1.2□□□□□ -2.6
SSK2P53599 COY1YKL179C 2040 nt-1.2□□□□□ -2.6
SSK2P53599 YDR199WYDR199W 366 nt-1.21□□□□□ -2.6
SSK2P53599 MFA1YDR461W 111 nt-1.21□□□□□ -2.6
SSK2P53599 YNL146WYNL146W 303 nt-1.21□□□□□ -2.6
SSK2P53599 KAR1YNL188W 1302 nt-1.21□□□□□ -2.6
SSK2P53599 NUP82YJL061W 2142 nt-1.21□□□□□ -2.6
SSK2P53599 LCD1YDR499W 2244 nt-1.21□□□□□ -2.6
SSK2P53599 SPO11YHL022C 1197 nt-1.21□□□□□ -2.6
SSK2P53599 NTC20YBR188C 423 nt-1.21□□□□□ -2.6
SSK2P53599 COX6YHR051W 447 nt-1.22□□□□□ -2.61
SSK2P53599 CSM4YPL200W 471 nt-1.22□□□□□ -2.61
SSK2P53599 YER038W-AYER038W-A 381 nt-1.24□□□□□ -2.61
SSK2P53599 YHL042WYHL042W 453 nt-1.24□□□□□ -2.61
SSK2P53599 MMS21YEL019C 804 nt-1.25□□□□□ -2.61
SSK2P53599 OST4YDL232W 111 nt-1.26□□□□□ -2.61
SSK2P53599 YNL089CYNL089C 477 nt-1.26□□□□□ -2.61
SSK2P53599 GRX5YPL059W 453 nt-1.26□□□□□ -2.61
SSK2P53599 COG1YGL223C 1254 nt-1.27□□□□□ -2.61
SSK2P53599 RPS25BYLR333C 327 nt-1.27□□□□□ -2.61
SSK2P53599 EST1YLR233C 2100 nt-1.28□□□□□ -2.61
SSK2P53599 YCR090CYCR090C 549 nt-1.28□□□□□ -2.61
SSK2P53599 AFB1YLR040C 675 nt-1.28□□□□□ -2.61
SSK2P53599 YLR311CYLR311C 348 nt-1.28□□□□□ -2.61
SSK2P53599 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-1.28□□□□□ -2.61
SSK2P53599 YDR344CYDR344C 444 nt-1.29□□□□□ -2.62
SSK2P53599 SWM2YNR004W 441 nt-1.29□□□□□ -2.62
SSK2P53599 CDC33YOL139C 642 nt-1.29□□□□□ -2.62
SSK2P53599 GIM5YML094W 492 nt-1.3□□□□□ -2.62
SSK2P53599 YOR345CYOR345C 351 nt-1.3□□□□□ -2.62
SSK2P53599 YGR115CYGR115C 780 nt-1.3□□□□□ -2.62
SSK2P53599 MVB12YGR206W 306 nt-1.3□□□□□ -2.62
SSK2P53599 SRP14YDL092W 441 nt-1.31□□□□□ -2.62
SSK2P53599 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-1.31□□□□□ -2.62
SSK2P53599 YLR282CYLR282C 342 nt-1.32□□□□□ -2.62
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