Protein–RNA interactions for Protein: P0CX15

YRF1-7, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-7P0CX15 STO1YMR125W 2586 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-7P0CX15 VPS74YDR372C 1038 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-7P0CX15 DFG10YIL049W 762 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-7P0CX15 BMT5YIL096C 1011 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-7P0CX15 ATP20YPR020W 348 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-7P0CX15 SAG1YJR004C 1953 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 SRB7YDR308C 423 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 AIM44YPL158C 2277 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 CYC7YEL039C 342 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 REF2YDR195W 1602 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YMR324CYMR324C 243 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 VPS52YDR484W 1926 nt0.25□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 PIG1YLR273C 1947 nt0.25□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 SDH2YLL041C 801 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 MLP1YKR095W 5628 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 BFR2YDR299W 1605 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 PXA2YKL188C 2562 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 SPO11YHL022C 1197 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 IRC13YOR235W 315 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 NPR2YEL062W 1848 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 DBP6YNR038W 1890 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 LOC1YFR001W 615 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 RPL37AYLR185W 267 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 UPS1YLR193C 528 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 GIM5YML094W 492 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YOR053WYOR053W 342 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 PDE2YOR360C 1581 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 UTP10YJL109C 5310 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 SLI15YBR156C 2097 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 ISD11YER048W-A 285 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 SPC2YML055W 537 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YPR099CYPR099C 357 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YDL152WYDL152W 366 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YOR199WYOR199W 330 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 SLM6YBR266C 453 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YDL206WYDL206W 2289 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-7P0CX15 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YAR053WYAR053W 297 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YOR366WYOR366W 354 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 SRP14YDL092W 441 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 LIN1YHR156C 1023 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 MMS4YBR098W 2076 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 MKT1YNL085W 2493 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 snR79snR79 84 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 IPI3YNL182C 1668 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 SPO23YBR250W 1572 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 ATC1YDR184C 885 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 ESP1YGR098C 4893 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 SLD3YGL113W 2007 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 OCA6YDR067C 675 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 POL32YJR043C 1053 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 RRT1YBL048W 312 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YOL106WYOL106W 354 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 snR13snR13 124 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 ZIP1YDR285W 2628 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 LCD1YDR499W 2244 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 RPS24BYIL069C 408 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YGR042WYGR042W 816 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 ULI1YFR026C 510 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YGL204CYGL204C 306 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 ABF2YMR072W 552 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YOP1YPR028W 543 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 CHS6YJL099W 2241 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 YBR184WYBR184W 1572 nt0.15□□□□□ -2.38
YRF1-7P0CX15 GLG1YKR058W 1851 nt0.15□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 ALG13YGL047W 609 nt0.15□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 GPG1YGL121C 381 nt0.15□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 ACF4YJR083C 930 nt0.15□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 LSO2YGR169C-A 279 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 CUP1-1YHR053C 186 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 CUP1-2YHR055C 186 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 YDR008CYDR008C 351 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 RPS7BYNL096C 573 nt0.14□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 RRI2YOL117W 1938 nt0.13□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.13□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 LOA1YPR139C 903 nt0.13□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 KAR1YNL188W 1302 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 RPL22BYFL034C-A 369 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 LRP1YHR081W 555 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 RPL32YBL092W 393 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 YPL197CYPL197C 414 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 URB1YKL014C 5295 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-7P0CX15 BI4Q0120 1917 nt0.12□□□□□ -2.39
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