Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO3A2RU48 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms