Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRIP3Q6Q6R5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms