Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTP4A2Q12974 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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PTP4A2Q12974 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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