Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YCR016WYCR016W 873 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YBR051WYBR051W 351 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 MKT1YNL085W 2493 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 DBP6YNR038W 1890 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 CHZ1YER030W 462 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 ISD11YER048W-A 285 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 NEJ1YLR265C 1029 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 DDR48YMR173W 1293 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YOL050CYOL050C 321 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 NTC20YBR188C 423 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YJL114WYJL114W 681 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 RPL32YBL092W 393 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YKE2YLR200W 345 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 NOC3YLR002C 1992 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 VPS52YDR484W 1926 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 IMP3YHR148W 552 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 IST3YIR005W 447 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 NBP1YLR457C 960 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 ATP18YML081C-A 180 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YOR199WYOR199W 330 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 SPR2YOR214C 711 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 NPR2YEL062W 1848 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 STO1YMR125W 2586 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 snR63snR63 255 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 SDH2YLL041C 801 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 VPS28YPL065W 729 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YCL020WYCL020W 1317 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 VPS74YDR372C 1038 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 AIM44YPL158C 2277 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 NOT5YPR072W 1683 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 SAG1YJR004C 1953 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 ALG13YGL047W 609 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YGR265WYGR265W 411 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 RPB10YOR210W 213 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YPR142CYPR142C 564 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 BFR2YDR299W 1605 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 HAL9YOL089C 3093 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 RUF22RUF22 515 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YBP2YGL060W 1926 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-BRQ12193 YDL009CYDL009C 324 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 RPL35AYDL191W 363 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 MET32YDR253C 576 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 FAR3YMR052W 615 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 SCW11YGL028C 1629 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 PDE2YOR360C 1581 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 RAD6YGL058W 519 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 DPB11YJL090C 2295 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 GEP7YGL057C 864 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 ROX1YPR065W 1107 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 CHS6YJL099W 2241 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 RPL37AYLR185W 267 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 YBR062CYBR062C 543 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 PXA2YKL188C 2562 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 AI5_BETAQ0075 1065 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 YKL115CYKL115C 393 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 snR190snR190 190 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 ENV11YGR071C 2583 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 YJL007CYJL007C 315 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 YJL032WYJL032W 315 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 SWI5YDR146C 2130 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 YDR199WYDR199W 366 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 MMS2YGL087C 414 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 TIM8YJR135W-A 264 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 BET4YJL031C 984 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY1B-BRQ12193 SPO11YHL022C 1197 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 CCE1YKL011C 1062 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 BIG1YHR101C 1008 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 PET111YMR257C 2403 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 RFA3YJL173C 369 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YOR105WYOR105W 327 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 GPI2YPL076W 843 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 MMS4YBR098W 2076 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 OCA6YDR067C 675 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 SLD3YGL113W 2007 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 RPC10YHR143W-A 213 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 CRG1YHR209W 876 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 COX12YLR038C 252 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 SWM2YNR004W 441 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 RTC6YPL183W-A 282 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YPR153WYPR153W 423 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YPR172WYPR172W 603 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 NIP100YPL174C 2607 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 SSS1YDR086C 243 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YDR114CYDR114C 303 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YEL010WYEL010W 351 nt-0.14□□□□□ -2.43
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