Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 DAD3YBR233W-A 285 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 SCD5YOR329C 2619 nt2.46□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 NUP100YKL068W 2880 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YGR069WYGR069W 336 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 MBB1YJL199C 327 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YLR053CYLR053C 327 nt2.45□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 RSE1YML049C 4086 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 SCH9YHR205W 2475 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 ALG13YGL047W 609 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YOR333CYOR333C 417 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 NUT2YPR168W 474 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 USO1YDL058W 5373 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 NEW1YPL226W 3591 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 PHO91YNR013C 2685 nt2.44□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YRB1YDR002W 606 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YGR265WYGR265W 411 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 RPS17AYML024W 411 nt2.43□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 SNF5YBR289W 2718 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YEF3YLR249W 3135 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 NPC2YDL046W 522 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YDL211CYDL211C 1119 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YMR045CYMR045C 5268 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 TOF1YNL273W 3717 nt2.42□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 HDA3YPR179C 1968 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 IRR1YIL026C 3453 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 MGM1YOR211C 2646 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 VPH1YOR270C 2523 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 TRS130YMR218C 3309 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YDL062WYDL062W 426 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YIL032CYIL032C 357 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 CLN3YAL040C 1743 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 MNL2YLR057W 2550 nt2.41□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 SSD1YDR293C 3753 nt2.4□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 EFR3YMR212C 2349 nt2.4□□□□□ -2.02
VHS3Q08438 YDR286CYDR286C 345 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YHL042WYHL042W 453 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 PCC1YKR095W-A 267 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 UPS1YLR193C 528 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 VPS34YLR240W 2628 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 CHC1YGL206C 4962 nt2.4□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 DNA2YHR164C 4569 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 NOP53YPL146C 1368 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 RAD61YDR014W 1944 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 JLP2YMR132C 627 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YBL083CYBL083C 426 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 KOG1YHR186C 4674 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 SEC16YPL085W 6588 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 MSB1YOR188W 3414 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 BNI1YNL271C 5862 nt2.39□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 SET2YJL168C 2202 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 GRR1YJR090C 3456 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YLR255CYLR255C 354 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YPR063CYPR063C 423 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 SGS1YMR190C 4344 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 VMR1YHL035C 4779 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 COG8YML071C 1824 nt2.38□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 TUS1YLR425W 3924 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 PXA2YKL188C 2562 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YNL114CYNL114C 372 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 PDR3YBL005W 2931 nt2.37□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 ZRG8YER033C 3231 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 snR80snR80 171 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 RPL42BYHR141C 321 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 RPL42AYNL162W 321 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 snR49snR49 165 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YOL098CYOL098C 3114 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 MET18YIL128W 3099 nt2.36□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 TOR2YKL203C 7425 nt2.35□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 MCD1YDL003W 1701 nt2.35□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YDR426CYDR426C 378 nt2.35□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.35□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 TRX1YLR043C 312 nt2.35□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.35□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 SLM1YIL105C 2061 nt2.35□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 ARP7YPR034W 1434 nt2.34□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 RPH1YER169W 2391 nt2.34□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 snR70snR70 164 nt2.34□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 MRP10YDL045W-A 288 nt2.34□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YFH1YDL120W 525 nt2.34□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.34□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.34□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 DNF1YER166W 4716 nt2.34□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.34□□□□□ -2.03
VHS3Q08438 YCR043CYCR043C 384 nt2.33□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 SDH2YLL041C 801 nt2.33□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 SKP2YNL311C 2292 nt2.33□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 JIP5YPR169W 1479 nt2.33□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.32□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 snR43snR43 209 nt2.32□□□□□ -2.04
VHS3Q08438 SWI6YLR182W 2412 nt2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.1 ms