Protein–RNA interactions for Protein: Q05931

SSQ1, Heat shock protein SSQ1, mitochondrial, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1Q05931 SIP4YJL089W 2490 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YDL152WYDL152W 366 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 SMB1YER029C 591 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YFL012WYFL012W 447 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 VMA21YGR105W 234 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 SPO13YHR014W 876 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YKL111CYKL111C 336 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 RCN1YKL159C 636 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 PAU18YLL064C 363 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 NBP1YLR457C 960 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 PKR1YMR123W 369 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 PAU6YNR076W 363 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 FMP23YBR047W 528 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 SPR3YGR059W 1539 nt1.08□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.07□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.07□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YGR265WYGR265W 411 nt1.07□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 RPL40BYKR094C 387 nt1.07□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YBR184WYBR184W 1572 nt1.07□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 TTI1YKL033W 3117 nt1.06□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.06□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 QCR7YDR529C 384 nt1.06□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.06□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YIL029CYIL029C 429 nt1.06□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 AFB1YLR040C 675 nt1.06□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YNL319WYNL319W 441 nt1.06□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 MSS11YMR164C 2277 nt1.06□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 NUP188YML103C 4968 nt1.06□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YPR117WYPR117W 7470 nt1.05□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YGR130CYGR130C 2451 nt1.05□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 RPL42BYHR141C 321 nt1.05□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YML003WYML003W 873 nt1.05□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YBL073WYBL073W 312 nt1.05□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 RPL42AYNL162W 321 nt1.05□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.04□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 TIM18YOR297C 579 nt1.04□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 DOP1YDR141C 5097 nt1.03□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 YLL020CYLL020C 306 nt1.03□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 GMC2YLR445W 567 nt1.03□□□□□ -2.24
SSQ1Q05931 ZRG17YNR039C 1818 nt1.03□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 BEM2YER155C 6504 nt1.03□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YDL016CYDL016C 303 nt1.02□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 MAK10YEL053C 2202 nt1.02□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YKL044WYKL044W 321 nt1.02□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 RPS18BYML026C 441 nt1.02□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 DDR48YMR173W 1293 nt1.02□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 IRC16YPR038W 360 nt1.02□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.02□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 SLM6YBR266C 453 nt1.02□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 SWI4YER111C 3282 nt1.01□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 SEC5YDR166C 2916 nt1.01□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 SHE9YDR393W 1371 nt1.01□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YJR141WYJR141W 1044 nt1.01□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt1.01□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YPR099CYPR099C 357 nt1.01□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 HDA3YPR179C 1968 nt1.01□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YDR509WYDR509W 348 nt1□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 RTR1YER139C 681 nt1□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 PRM8YGL053W 714 nt1□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YGL217CYGL217C 342 nt1□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YOR248WYOR248W 303 nt1□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 IFH1YLR223C 3258 nt0.99□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 CDC39YCR093W 6327 nt0.99□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 KAP120YPL125W 3099 nt0.99□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YDR008CYDR008C 351 nt0.99□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 OCA6YDR067C 675 nt0.99□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 RTT102YGR275W 474 nt0.99□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YLL054CYLL054C 2532 nt0.99□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 PPN1YDR452W 2025 nt0.98□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 NUT1YGL151W 3399 nt0.98□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.98□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 PAU2YEL049W 363 nt0.98□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.98□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 SLX4YLR135W 2247 nt0.98□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 EAF1YDR359C 2949 nt0.98□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 PAN3YKL025C 2040 nt0.98□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 VPS54YDR027C 2670 nt0.97□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 RAD50YNL250W 3939 nt0.97□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.97□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 BER1YLR412W 825 nt0.97□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YOP1YPR028W 543 nt0.97□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 SGO1YOR073W 1773 nt0.97□□□□□ -2.25
SSQ1Q05931 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.96□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 TMA22YJR014W 597 nt0.96□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 snR14snR14 160 nt0.96□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 YBR032WYBR032W 303 nt0.96□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 YPR039WYPR039W 336 nt0.96□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 HNT1YDL125C 477 nt0.95□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 HIT1YJR055W 495 nt0.95□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 UBX4YMR067C 1251 nt0.95□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 HCH1YNL281W 462 nt0.95□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 STB6YKL072W 2301 nt0.95□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 SRP14YDL092W 441 nt0.94□□□□□ -2.26
SSQ1Q05931 YER135CYER135C 393 nt0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 84.6 ms