Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 TRM732YMR259C 4263 nt1.03□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 MSH5YDL154W 2706 nt1.03□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.03□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YAP3YHL009C 993 nt1.03□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YPR146CYPR146C 330 nt1.03□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 SMC4YLR086W 4257 nt1.03□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 PPN1YDR452W 2025 nt1.02□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 DGR2YKL121W 2559 nt1.02□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 MVP1YMR004W 1536 nt1.02□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 SWT1YOR166C 1377 nt1.02□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YPR063CYPR063C 423 nt1.02□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.01□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 PBI2YNL015W 228 nt1.01□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 SLM6YBR266C 453 nt1.01□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 SGD1YLR336C 2700 nt1.01□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 UFD2YDL190C 2886 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 SHE9YDR393W 1371 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 RPF1YHR088W 888 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 RPL34BYIL052C 366 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 FYV7YLR068W 456 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 CGI121YML036W 546 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YNL122CYNL122C 348 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 MSS11YMR164C 2277 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 PEP3YLR148W 2757 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 SNF5YBR289W 2718 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 SMY1YKL079W 1971 nt0.99□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 RPL16AYIL133C 600 nt0.99□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YLR269CYLR269C 351 nt0.99□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YOR248WYOR248W 303 nt0.99□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YPR039WYPR039W 336 nt0.99□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YJR029WYJR029W 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 SPO75YLL005C 2607 nt0.99□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 SPT7YBR081C 3999 nt0.98□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 SIP4YJL089W 2490 nt0.98□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 SAC3YDR159W 3906 nt0.98□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.98□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.98□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YGR045CYGR045C 363 nt0.98□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 BIG1YHR101C 1008 nt0.98□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 ABM1YJR108W 372 nt0.98□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.98□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 NUP120YKL057C 3114 nt0.98□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 MMS22YLR320W 4365 nt0.97□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 CDC24YAL041W 2565 nt0.97□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YER121WYER121W 345 nt0.97□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 Q0144Q0144 330 nt0.97□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.97□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YOR376WYOR376W 369 nt0.97□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 TSC3YBR058C-A 243 nt0.97□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 YGR130CYGR130C 2451 nt0.97□□□□□ -2.25
NUP49Q02199 MXR1YER042W 555 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 IES5YER092W 378 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 PRE4YFR050C 801 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YGR025WYGR025W 303 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 CRG1YHR209W 876 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 AIM29YKR074W 468 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 BEM2YER155C 6504 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 NUP188YML103C 4968 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 MUK1YPL070W 1839 nt0.96□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 OSH6YKR003W 1347 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YCR001WYCR001W 315 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YDL211CYDL211C 1119 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 QCR7YDR529C 384 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 HUR1YGL168W 333 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 RPS18BYML026C 441 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YML108WYML108W 318 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 TOM22YNL131W 459 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 CDC33YOL139C 642 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 HHT1YBR010W 411 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 Q0017Q0017 162 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 TTI1YKL033W 3117 nt0.95□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 DCP2YNL118C 2913 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YER135CYER135C 393 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YHR130CYHR130C 336 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 RPL42BYHR141C 321 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 RPL42AYNL162W 321 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 ATP19YOL077W-A 207 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 snR13snR13 124 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YBR184WYBR184W 1572 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 IML1YJR138W 4755 nt0.94□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 NST1YNL091W 3723 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 BI2Q0110 1272 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 EMC5YIL027C 426 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YML003WYML003W 873 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 snR41snR41 95 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 SEF1YBL066C 3447 nt0.93□□□□□ -2.26
NUP49Q02199 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.7 ms