Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SEC24CP53992 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24CP53992 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms