Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 NIP100YPL174C 2607 nt2.8□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 VPS16YPL045W 2397 nt2.8□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 ECM12YHR021W-A 456 nt2.8□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 RPB10YOR210W 213 nt2.8□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 SCH9YHR205W 2475 nt2.8□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 IRR1YIL026C 3453 nt2.8□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 TOM1YDR457W 9807 nt2.8□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 YBT1YLL048C 4986 nt2.79□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 snR72snR72 98 nt2.79□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 YHL005CYHL005C 393 nt2.79□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 RPL42BYHR141C 321 nt2.79□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.79□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 RPL42AYNL162W 321 nt2.79□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 YBR277CYBR277C 402 nt2.79□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 RFX1YLR176C 2436 nt2.79□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 RTT10YPL183C 3042 nt2.79□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 SEC7YDR170C 6030 nt2.78□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 AFI1YOR129C 2682 nt2.78□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 ACB1YGR037C 264 nt2.78□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 CRM1YGR218W 3255 nt2.78□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 GCV2YMR189W 3105 nt2.78□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 NUM1YDR150W 8247 nt2.78□□□□□ -1.96
YAR028WP39548 ORC2YBR060C 1863 nt2.77□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 RPL6AYML073C 531 nt2.77□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 CRS5YOR031W 210 nt2.77□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 ECM29YHL030W 5607 nt2.77□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 NFT1YKR103W 3657 nt2.77□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YDR186CYDR186C 2634 nt2.76□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YIL080WYIL080W 4722 nt2.76□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 SNC1YAL030W 354 nt2.76□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 EMC6YLL014W 327 nt2.76□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 ESL1YIL151C 3357 nt2.76□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 MCM10YIL150C 1716 nt2.76□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 PTP3YER075C 2787 nt2.76□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 RGC1YPR115W 3252 nt2.76□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 SPO75YLL005C 2607 nt2.75□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YKU80YMR106C 1890 nt2.75□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 MNL2YLR057W 2550 nt2.75□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 SLY1YDR189W 2001 nt2.75□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 RPA190YOR341W 4995 nt2.75□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 SPC98YNL126W 2541 nt2.75□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 PRP42YDR235W 1635 nt2.75□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 INP52YNL106C 3552 nt2.75□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YLR278CYLR278C 4026 nt2.74□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 ECM21YBL101C 3354 nt2.74□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 ROM1YGR070W 3468 nt2.74□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YIL169CYIL169C 2988 nt2.73□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YGR067CYGR067C 2415 nt2.73□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 MMS22YLR320W 4365 nt2.73□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 SWI5YDR146C 2130 nt2.73□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 DYN2YDR424C 279 nt2.73□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 SNU13YEL026W 381 nt2.73□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YEL073CYEL073C 324 nt2.73□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YBL053WYBL053W 375 nt2.73□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 GIS1YDR096W 2685 nt2.73□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 INP53YOR109W 3324 nt2.72□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 PMP1YCR024C-A 123 nt2.72□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.72□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt2.72□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.72□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 RPL33BYOR234C 324 nt2.72□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 RRP6YOR001W 2202 nt2.72□□□□□ -1.97
YAR028WP39548 ILS1YBL076C 3219 nt2.71□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.71□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.71□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YBL012CYBL012C 402 nt2.71□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YBR174CYBR174C 315 nt2.71□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 RAX2YLR084C 3663 nt2.71□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 LYS14YDR034C 2373 nt2.71□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 MGM1YOR211C 2646 nt2.7□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 FRE2YKL220C 2136 nt2.7□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 SMY2YBR172C 2223 nt2.7□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 ZRG8YER033C 3231 nt2.7□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 SSN2YDR443C 4263 nt2.7□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 INP51YIL002C 2841 nt2.69□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 VMR1YHL035C 4779 nt2.69□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 SET2YJL168C 2202 nt2.69□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 CDC53YDL132W 2448 nt2.69□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.69□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.69□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YOR345CYOR345C 351 nt2.69□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 SWR1YDR334W 4545 nt2.69□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YLL007CYLL007C 1998 nt2.69□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 SLM1YIL105C 2061 nt2.69□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 KAP104YBR017C 2757 nt2.68□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 CBF2YGR140W 2871 nt2.68□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 SPO21YOL091W 1830 nt2.68□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 CYR1YJL005W 6081 nt2.68□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 SRP14YDL092W 441 nt2.68□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 EMP24YGL200C 612 nt2.68□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YIR044CYIR044C 186 nt2.68□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 ELG1YOR144C 2376 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 HYP2YEL034W 474 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.67□□□□□ -1.98
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