Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 MGM1YOR211C 2646 nt2.44□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 SLM1YIL105C 2061 nt2.43□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 BNI1YNL271C 5862 nt2.43□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 MRP10YDL045W-A 288 nt2.43□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YDL062WYDL062W 426 nt2.43□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 ALG13YGL047W 609 nt2.43□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 RPS29AYLR388W 171 nt2.43□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 SET2YJL168C 2202 nt2.43□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 NOP53YPL146C 1368 nt2.43□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 EDS1YBR033W 2760 nt2.43□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YPL150WYPL150W 2706 nt2.42□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YDR426CYDR426C 378 nt2.42□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YHL042WYHL042W 453 nt2.42□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.42□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 STH1YIL126W 4080 nt2.42□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 SWI6YLR182W 2412 nt2.42□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 TRS130YMR218C 3309 nt2.42□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 NUP100YKL068W 2880 nt2.41□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 SMC6YLR383W 3345 nt2.41□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 RAD61YDR014W 1944 nt2.41□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YNL114CYNL114C 372 nt2.41□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 PDR1YGL013C 3207 nt2.41□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 SVL3YPL032C 2478 nt2.4□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YDR286CYDR286C 345 nt2.4□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.4□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.4□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 JLP2YMR132C 627 nt2.4□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.4□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YOL098CYOL098C 3114 nt2.4□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 VTC3YPL019C 2508 nt2.4□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 BUB1YGR188C 3066 nt2.4□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 ZRG8YER033C 3231 nt2.39□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 UBR1YGR184C 5853 nt2.39□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 PXA2YKL188C 2562 nt2.39□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 CFT2YLR115W 2580 nt2.39□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YOR055WYOR055W 435 nt2.39□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YPR063CYPR063C 423 nt2.39□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 COG8YML071C 1824 nt2.39□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YGR250CYGR250C 2346 nt2.38□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.38□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 MMS22YLR320W 4365 nt2.38□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 snR80snR80 171 nt2.37□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.37□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.37□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 PAU8YAL068C 363 nt2.37□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.37□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 PAU20YOL161C 363 nt2.37□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 snR49snR49 165 nt2.37□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 RPH1YER169W 2391 nt2.37□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 SWI5YDR146C 2130 nt2.36□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 RAV1YJR033C 4074 nt2.36□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YCR043CYCR043C 384 nt2.36□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 snR60snR60 104 nt2.36□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YRB1YDR002W 606 nt2.36□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.36□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YLR255CYLR255C 354 nt2.36□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 MCD1YDL003W 1701 nt2.36□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 SSQ1YLR369W 1974 nt2.36□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 PTP3YER075C 2787 nt2.35□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 TRX1YLR043C 312 nt2.35□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 MNE1YOR350C 1992 nt2.35□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 MUK1YPL070W 1839 nt2.35□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 SSD1YDR293C 3753 nt2.35□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 RSE1YML049C 4086 nt2.35□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 ARP7YPR034W 1434 nt2.34□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 YFH1YDL120W 525 nt2.34□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 snR43snR43 209 nt2.34□□□□□ -2.03
SSZ1P38788 MET18YIL128W 3099 nt2.33□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 MVP1YMR004W 1536 nt2.33□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 SDH2YLL041C 801 nt2.33□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 RPS17AYML024W 411 nt2.33□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 IRR1YIL026C 3453 nt2.33□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 SLY1YDR189W 2001 nt2.33□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 INP2YMR163C 2118 nt2.32□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 CLN3YAL040C 1743 nt2.32□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 BLI1YKL061W 342 nt2.32□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 SCD5YOR329C 2619 nt2.32□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 HCS1YKL017C 2052 nt2.32□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 USO1YDL058W 5373 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 CDC36YDL165W 576 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 TIM9YEL020W-A 264 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 EMP24YGL200C 612 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 RPB10YOR210W 213 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 GIP3YPL137C 3831 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 YBR064WYBR064W 429 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 STE11YLR362W 2154 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 RFX1YLR176C 2436 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 SCW11YGL028C 1629 nt2.31□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.3□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 YGL041CYGL041C 204 nt2.3□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 ABF2YMR072W 552 nt2.3□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 YNL337WYNL337W 255 nt2.3□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.3□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 DNF1YER166W 4716 nt2.3□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 TRL1YJL087C 2484 nt2.29□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 YJL135WYJL135W 318 nt2.29□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 PAU18YLL064C 363 nt2.29□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.29□□□□□ -2.04
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