Protein–RNA interactions for Protein: P21771

MRPS28, 37S ribosomal protein S28, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS28	P21771	PAU18	YLL064C	363 nt		1	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	PAU6	YNR076W	363 nt		1	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	YBR184W	YBR184W	1572 nt		1	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	SEF1	YBL066C	3447 nt		0.99	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	SMB1	YER029C	591 nt		0.99	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	VMA21	YGR105W	234 nt		0.99	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	YGR265W	YGR265W	411 nt		0.99	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	SPO13	YHR014W	876 nt		0.99	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	EMC5	YIL027C	426 nt		0.99	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	RPL40B	YKR094C	387 nt		0.99	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	NBP1	YLR457C	960 nt		0.99	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	SEC5	YDR166C	2916 nt		0.99	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	NUP188	YML103C	4968 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	YDL152W	YDL152W	366 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	QCR7	YDR529C	384 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	YER188C-A	YER188C-A	300 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	YFL012W	YFL012W	447 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	RPL42B	YHR141C	321 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	RPL42A	YNL162W	321 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	YNL319W	YNL319W	441 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	YOR376W	YOR376W	369 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	YPR146C	YPR146C	330 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	SIP4	YJL089W	2490 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	YHR214C-C	YHR214C-C	1437 nt		0.98	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	RTT102	YGR275W	474 nt		0.97	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		0.97	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	SPC1	YJR010C-A	285 nt		0.97	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	AFB1	YLR040C	675 nt		0.97	□□□□□ -2.25
MRPS28	P21771	BUD3	YCL014W	4911 nt		0.96	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	UFD2	YDL190C	2886 nt		0.96	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		0.96	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YIL029C	YIL029C	429 nt		0.96	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	RPS18B	YML026C	441 nt		0.96	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YBL073W	YBL073W	312 nt		0.96	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	FMP23	YBR047W	528 nt		0.96	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	ROM2	YLR371W	4071 nt		0.96	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YCS4	YLR272C	3531 nt		0.95	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	ZRG17	YNR039C	1818 nt		0.95	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YDL211C	YDL211C	1119 nt		0.95	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		0.95	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	DDR48	YMR173W	1293 nt		0.95	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	snR14	snR14	160 nt		0.95	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YPR063C	YPR063C	423 nt		0.95	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YBR121C-A	YBR121C-A	159 nt		0.95	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	RAD50	YNL250W	3939 nt		0.95	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	MUK1	YPL070W	1839 nt		0.94	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YDL016C	YDL016C	303 nt		0.94	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YKL044W	YKL044W	321 nt		0.94	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	GMC2	YLR445W	567 nt		0.94	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	IRC16	YPR038W	360 nt		0.94	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	SLM6	YBR266C	453 nt		0.94	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	TTI1	YKL033W	3117 nt		0.93	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	PRM8	YGL053W	714 nt		0.93	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YGL217C	YGL217C	342 nt		0.93	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YJR141W	YJR141W	1044 nt		0.93	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YBL029C-A	YBL029C-A	285 nt		0.93	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YPR099C	YPR099C	357 nt		0.93	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	HDA3	YPR179C	1968 nt		0.93	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	SHE9	YDR393W	1371 nt		0.93	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	IFH1	YLR223C	3258 nt		0.93	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	CDC39	YCR093W	6327 nt		0.92	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YHL009W-A	YHL009W-A	1242 nt		0.92	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	HCH1	YNL281W	462 nt		0.92	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	TIM18	YOR297C	579 nt		0.92	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	MAK10	YEL053C	2202 nt		0.92	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YDR509W	YDR509W	348 nt		0.91	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	YOR248W	YOR248W	303 nt		0.91	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	SLX4	YLR135W	2247 nt		0.91	□□□□□ -2.26
MRPS28	P21771	PPN1	YDR452W	2025 nt		0.9	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	YDR003W-A	YDR003W-A	123 nt		0.9	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	YDR008C	YDR008C	351 nt		0.9	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	PAU2	YEL049W	363 nt		0.9	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	PIP2	YOR363C	2991 nt		0.9	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	YOP1	YPR028W	543 nt		0.9	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	SEC3	YER008C	4011 nt		0.9	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	NUT1	YGL151W	3399 nt		0.9	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		0.89	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	SPR3	YGR059W	1539 nt		0.89	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	PAN3	YKL025C	2040 nt		0.89	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	OCA6	YDR067C	675 nt		0.89	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		0.89	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	YLL020C	YLL020C	306 nt		0.89	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	BER1	YLR412W	825 nt		0.89	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	VPS54	YDR027C	2670 nt		0.89	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	SRP14	YDL092W	441 nt		0.88	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	HNT1	YDL125C	477 nt		0.88	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	RTR1	YER139C	681 nt		0.88	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	TMA22	YJR014W	597 nt		0.88	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	YBR032W	YBR032W	303 nt		0.88	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	YPR039W	YPR039W	336 nt		0.88	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	STB6	YKL072W	2301 nt		0.88	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	EAF1	YDR359C	2949 nt		0.88	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	SWI4	YER111C	3282 nt		0.88	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	UBX4	YMR067C	1251 nt		0.87	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	SWI5	YDR146C	2130 nt		0.86	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	SGO1	YOR073W	1773 nt		0.86	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	snR84	snR84	550 nt		0.86	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	YER135C	YER135C	393 nt		0.86	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	HIT1	YJR055W	495 nt		0.86	□□□□□ -2.27
MRPS28	P21771	ERP4	YOR016C	624 nt		0.86	□□□□□ -2.27

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