Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP58Q9Y2X3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOP58Q9Y2X3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms