Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DPM3Q9P2X0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms